무엇이 검증이고
무엇이 검증이 아닌가
I 권이 에피토프를 골랐고 II 권이 구조물을 지었습니다. 이 권은 그 구조물을 검사했다고 말하는 일곱 가지를 하나씩 뜯습니다.
도킹 · 정규모드 · 적용범위 · 면역 모의실험 · 코돈 최적화 · RNA 접힘 · RNA-TLR 도킹. 일곱 가운데 실험으로 잰 것은 하나도 없습니다.
그렇다고 쓸모가 없다는 뜻이 아닙니다 — 인실리코 선별은 실험실이 못 하는 속도로 물음을 좁힙니다. 이 권의 물음은 좁습니다: 그 결과를 무엇이라고 부를 것인가.
파이썬은 이 페이지 안에서 바로 실행됩니다. 설치할 것은 없습니다.
이렇게 배웁니다
📏단위부터 묻는다
ClusPro 점수 · C-IMMSIM 항체값 · HDOCK 신뢰도는 단위가 없거나 내부 단위입니다. 견줄 수 있는지부터 봅니다.
🔢세는 것과 재는 것을 가른다
수소결합 22개 대 6개인데 점수는 반대쪽입니다. 고른 눈금이 결론을 정합니다.
🌍평균이 감추는 곳을 본다
97.49% 와 23.88% 가 같은 표에 있습니다. 어느 쪽을 초록에 적을지가 주장입니다.
✍️말을 고른다
예측했다 · 시사한다 · 뒷받침한다 · 보였다 · 증명했다. 20강에서 이 눈금으로 선을 긋습니다.
전체 커리큘럼
01
설계가 끝난 뒤에 하는 일곱 가지
Results 5~8 · 무엇이 검증이고 무엇이 아닌가
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02
TLR2 와 TLR4 에 붙이다 — ClusPro 의 점수는 에너지가 아니다
Methods 7 · Table 5 윗칸
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03
HADDOCK 으로 다듬기 — 점수 하나에 네 가지가 들어 있다
Methods 7 · Table 5 가운뎃칸
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04
수소결합 스물둘이 여섯보다 낫다는 말
Table 5 아랫칸 · PDBsum
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05
흔들림 ±16.0 이 뜻하는 것
Table 5 · HADDOCK score 의 표준편차
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06
iMODS 의 정규모드 — 분자동역학이라는 이름의 두 가지
Methods 8 · Fig 5C-5D · Fig 6C-6D
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07
적용범위 97.49% — IEDB 가 세는 법
Methods 9 · Fig 7 · S2 Table
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08
평균이 감추는 것 — 중앙아메리카 23.88%
Fig 7 · S2 Table · 논의 절
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09
소외열대질환 학술지에 실린다는 뜻
PLoS Negl Trop Dis 20(4) · e0013517
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10
1000걸음이 350일인 까닭 — 모의실험의 시계
Methods 9 · Fig 8
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11
IgM+IgG 1.6×10⁵ — 눈금 없는 그래프를 읽는 법
Fig 8A · 결과 7
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12
여섯 대립유전자로 돌린 모의실험
Methods 9 · 97.49% 와 무슨 관계인가
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13
코돈 최적화 — CAI 0.91 과 GC 61%
Methods 10 · 결과 8 · S2 Fig
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14
5'UTR 과 3'UTR 과 폴리A 120 — 그리고 없는 것 하나
Methods 10 · 결과 8
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15
−678.61 kcal/mol — 앙상블 자유에너지는 MFE 가 아니다
Methods 11 · 결과 8 · S3 Fig
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16
mRNA 를 TLR3·7·8 에 붙이다 — 문턱 0.5 와 신뢰도 0.9
Methods 11 · 결과 8 · S3 Table
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17
켜려는 설계와 끄는 산업 — 갈림길 하나
결과 8 · 논의 · 본문 검색 결과
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18
pET-28a(+) 와 BamHI — 그리고 문장의 시제
Methods 10 · 결과 8 마지막 문단 · S4 Fig
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19
저자가 스스로 적은 검증 로드맵 네 걸음
논의 절 · stepwise experimental validation roadmap
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20
말할 수 있는 것과 말할 수 없는 것
SPOW Vol.1 No.8 · 심사표의 R5
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