18강 / 20강

면역을 재는 도구들 — 무엇을 얻고 무엇을 잃나

H&E · 유세포 · 단일세포 · 공간전사체 · 그리고 이 사이트의 강의들

면역을 재는 도구들 — 무엇을 얻고 무엇을 잃나
모든 측정은 맞바꿈입니다. 수를 얻으면 위치를 잃고, 위치를 얻으면 깊이를 잃습니다.

지금까지 배운 개념들은 재야 뜻이 생깁니다. 그런데 도구마다 보이는 것이 다릅니다.

도구얻는 것잃는 것논문에서강의
H&E + 딥러닝위치 · 아주 많은 환자 세포의 종류와 상태Fig 1 · 4E/til
유세포분석정확한 개수 · 단백질 위치를 완전히 잃는다Fig 4F/cytohist
벌크 RNA-seq유전자 2만 개 전부 세포가 섞여 평균이 된다Fig 3 · 6/bio /bulk
단일세포 RNA-seq세포마다 유전자 2만 개 위치 · 조직을 갈아야 한다Fig 5H-L · 7/immune
공간전사체위치 + 유전자 5천 개 유전자 수 · 세포당 깊이Fig 5A-G · 8/spatial

논문이 다섯 가지를 다 쓴 이유가 여기 있습니다. 어느 하나도 혼자서는 "면역세포가 종양 안으로 들어왔다" 를 증명하지 못해요.

물음 하나를 고르면 어떤 도구가 답할 수 있는지 보여 줍니다.
불러오는 중…
이 표가 논문의 그림 배치를 그대로 설명합니다.
Python 브라우저에서 실행

이 사이트의 강의 지도

지금 여러분이 듣는 강의는 말을 다뤘습니다. 그 말들을 자료로 확인하는 강의가 따로 있습니다.

🧬
계산으로
/bio RNA-seq 기초
/gene 마스터 조절자 찾기
/arac /viper /diggit 알고리즘 셋
/mirna miRNA 층
🔬
자료로
/til H&E 지도
/immune 단일세포 면역지도
/spatial 공간전사체
/dataset /bulk 원자료 다루기
🧫
실험으로
/wetlab 세포배양
/perturb 유전자 조작
/molassay qPCR · 웨스턴
/invivo 동물실험 · /cytohist 유세포·조직

이 강의에서 배운 말 하나하나가 저 강의들의 어느 강에 대응하는지 20강에서 표로 정리합니다.

🤔 확인 문제
유세포분석이 완전히 잃는 정보는?
🤔 확인 문제
논문이 같은 종양을 H&E 와 유세포분석으로 두 번 센 이유는?
🤔 확인 문제
공간전사체가 단일세포 RNA-seq 에 비해 잃는 것은?