Lesson 9 of 20

먹지 마 · 굶어라 — CD47 과 CD38

논문 Fig 6 의 두 주인공 · 암세포가 표면에 내거는 팻말

8강의 PD-L1 은 T세포에게 거는 브레이크였습니다. 암세포에는 다른 세포에게 거는 브레이크도 있어요. 둘이 논문 Fig 6 의 주인공입니다.

CD47 — "나를 먹지 마"

대식세포 표면의 SIRPα 에 붙습니다. 붙으면 대식세포가 삼키던 동작을 멈추고 지나갑니다.

원래는 적혈구가 쓰는 신호예요 — "나는 건강하니 잡아먹지 마". 늙은 적혈구는 CD47 이 줄어 비장에서 제거됩니다.

CD38 — "너희 밥을 뺏겠다"

표면에 붙은 효소입니다. 세포 밖의 NAD⁺ 를 부숴 ADPR · cADPR 로 만들어요.

T세포는 NAD⁺ 가 있어야 증식하고 사이토카인을 만듭니다. 주변의 NAD⁺ 를 없애면 T세포가 굶습니다.

둘 다 암세포 표면에 있고, 둘 다 이미 임상시험 중인 표적입니다. 그래서 논문이 "DDX54 를 끄면 이 둘이 함께 내려간다" 를 보인 것이 뜻이 큽니다.

High school암세포가 표면에 내거는 두 팻말

8강의 PD-L1 은 T세포에게 거는 브레이크였습니다. 암세포에는 다른 세포에게 거는 것도 있어요. 둘을 봅니다.

팻말	누구에게	뜻	수법
CD47	대식세포	"나를 먹지 마"	삼키려던 동작을 멈추게 한다
CD38	T세포	"너희 밥을 뺏겠다"	주변의 영양분을 부숴 굶긴다

CD47 — 원래는 적혈구의 신분증입니다

CD47 은 암이 발명한 게 아니에요. 적혈구가 쓰던 신호입니다.

적혈구는 온몸을 돌아다니는데, 대식세포가 보이는 족족 잡아먹으면 곤란하죠. 그래서 "나는 건강하니 잡아먹지 마" 라는 표시를 달고 다닙니다. 그게 CD47 이에요.

그리고 늙은 적혈구는 CD47 이 줄어듭니다. 그러면 비장에서 제거돼요. 아주 우아한 수명 관리 장치입니다.

암세포는 이 신분증을 위조해서 달고 다닌다

8강 끝에서 말한 그 패턴이 또 나왔습니다 — 암은 새 무기를 발명하지 않고 몸이 쓰던 장치를 가져다 씁니다.

CD38 — 밥을 뺏는 쪽

CD38 은 표면에 붙은 효소입니다. 세포 밖의 NAD⁺ 라는 분자를 부숴요.

T세포는 NAD⁺ 가 있어야 증식하고 사이토카인을 만듭니다. 주변의 NAD⁺ 를 없애면? T세포가 굶습니다.

둘 다 이미 임상시험 중인 표적입니다. 그래서 논문이 "DDX54 를 끄면 이 둘이 함께 내려간다" 를 보인 것이 뜻이 큽니다.

이 숫자는 /bio 강의 15강에서 학생이 직접 계산하는 값과 같습니다.

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# 논문 Fig 6 - Ddx54 를 끄면 이 둘이 정말 내려가나
# /bio 강의가 GEO 원자료(GSE285342)로 계산한 값
결과 = [("Ddx54", -0.81, 0.0000, "우리가 끈 유전자 - 잘 꺼졌는지 확인"),
        ("Cd47",  -0.69, 0.0001, "'먹지 마' 팻말"),
        ("Cd38",  -0.87, 0.0010, "NAD+ 를 부수는 효소"),
        ("Myc",   -0.92, 0.0002, "Cd47 을 켜는 전사인자 중 하나")]

print(f"{'유전자':<8}{'log2FC':>9}{'p':>10}   {'무엇'}")
print("-" * 74)
for g, lfc, p, 설명 in 결과:
    별 = " *" if p < 0.05 else "  "
    print(f"{g:<8}{lfc:>+9.2f}{p:>10.4f}{별} {설명}")
print()
print("음수 = Ddx54 를 끄자 함께 내려갔다.")
print(f"Cd47 은 2^{-0.69:.2f} = {2**-0.69:.2f}배, 즉 약 {(1-2**-0.69)*100:.0f}% 줄었습니다.")
print("극적이지는 않습니다. '스위치를 껐다'가 아니라 '볼륨을 낮췄다'에 가까워요.")

High school38% 감소가 시시해 보이는 함정

위 코드 결과가 좀 김빠질 수 있습니다. CD47 이 38% 정도 줄었을 뿐이거든요. 사라진 게 아니에요.

"스위치를 껐다" 가 아니라 "볼륨을 낮췄다"

log2FC 라는 표기부터

표에 log2FC −0.69 같은 값이 나옵니다. 읽는 법만 알면 됩니다.

log2FC	몇 배	뜻
+1	2배	두 배로 늘었다
0	1배	그대로
−1	0.5배	절반이 됐다
−0.69	0.62배	약 38% 줄었다

왜 이렇게 복잡하게 쓰냐면 — 2배와 절반이 대칭이 되기 때문입니다. 그냥 배수로 쓰면 2배는 +1 인데 절반은 −0.5 라 눈금이 찌그러져요. log 를 씌우면 +1 과 −1 로 나란해집니다.

그래서 38% 는 충분한가

유전자 하나만 보면 시시합니다. 그런데 논문의 주장은 "CD47 이 극적으로 사라졌다" 가 아닙니다.

여러 방패가 동시에 조금씩 내려갔다

CD47 −0.69 · CD38 −0.87 · Myc −0.92, 그리고 EMT · 줄기성 시그니처 전체.

비유 — 자물쇠 하나 vs 자물쇠 열 개

	자물쇠 하나를 완전히 부순다	자물쇠 열 개를 40%씩 헐겁게 한다
장점	표적이 분명하다. 약 만들기 쉽다	우회로가 없다. 하나 막혀도 다른 게 남지 않는다
단점	나머지 아홉으로 돌아간다	효과가 약해 보인다. 기전 설명이 어렵다

어느 쪽이 나은지는 자명하지 않습니다. 그리고 마스터 조절자를 찾는 연구가 노리는 것은 오른쪽이에요.

여기서 배울 것

효과의 크기만 보지 말고 범위를 함께 보라

"38% 밖에 안 줄었네" 는 절반만 본 겁니다. "몇 개가 함께 줄었나" 를 물어야 이 논문의 주장이 보입니다.

High schoolT세포를 죽이지 않고 일 못 하게 만들기

CD38 의 기전을 조금 더 풀어 봅시다. 여기에 측정에 관한 교훈이 숨어 있습니다.

NAD⁺ 가 뭔가요

세포의 에너지 장부 같은 분자입니다. 대사에도 쓰이고 신호에도 쓰여요. 생명과학에서 배운 NADH 의 짝이라고 보면 됩니다.

CD38 : NAD⁺ → ADPR + cADPR (부순다)

그러면 T세포에 두 가지 일이 생깁니다

무슨 일	T세포에
NAD⁺ 가 줄어든다	증식 · 사이토카인 생산 · 세포독성이 모두 떨어진다
ADPR · cADPR 이 늘어난다	칼슘 신호가 흐트러져 활성화 자체가 잘 안 된다

여기가 핵심입니다

CD38 은 T세포를 죽이지 않는다. 일을 못 하게 만든다

비유 — 시험을 방해하는 두 가지 방법

학생을 못 오게 한다 — 출석부를 보면 바로 티가 납니다
밤새 잠을 못 자게 한다 — 출석은 다 했습니다. 출석부로는 아무 문제가 없어 보여요. 그런데 점수가 안 나옵니다

CD38 은 두 번째 방식입니다. 그래서 —

세포 수를 세는 검사로는 안 보인다. 기능을 재야 보인다

이게 왜 중요한가

연구자가 "T세포가 충분히 있다" 를 확인하고 안심할 수 있다는 뜻입니다. 그런데 그 T세포들이 아무 일도 못 하고 있을 수 있어요.

머릿수는 정상인데 결과가 안 나올 때, "수" 말고 "상태"를 재 봤나 를 물어야 합니다. 11~12강에서 이 이야기를 제대로 다룹니다.

세는 것이 가장 쉬운 일이라 우리는 자꾸 세기만 합니다. 세기 쉬운 것과 알고 싶은 것이 같지 않을 때가 많다는 것 — 자료를 다루는 사람이 늘 경계해야 하는 자리입니다.

왜 CD38 이 T세포를 굶기나 — NAD⁺ 이야기

NAD⁺ 는 세포의 에너지 화폐를 세는 장부 같은 분자입니다. 대사에도 쓰이고, 신호에도 쓰여요.

CD38 : NAD⁺ → ADPR + cADPR

논문 Discussion 이 이 기전을 두 갈래로 설명합니다.

무슨 일	T세포에 미치는 영향
NAD⁺ 가 줄어든다	증식 · 사이토카인 생산 · 세포독성이 모두 떨어진다
ADPR · cADPR 이 늘어난다	칼슘 신호가 흐트러져 활성화 자체가 잘 안 된다

즉 CD38 은 T세포를 죽이지 않습니다. 일을 못 하게 만듭니다. 그래서 세포 수를 세는 검사로는 잘 안 보이고, 기능을 재야 보여요. 11~12강에서 다시 만납니다.

논문은 이 그림을 웨스턴블롯 세 장(Fig 6 C·E·G)으로 뒷받침합니다 — /molassay 강의가 그 실험을 다룹니다.

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# 논문이 든 세 경로 - CD38 과 CD47 을 켜는 스위치들
경로 = {
    "Myc":       ["Cd47"],
    "Jak-Stat3": ["Cd47"],
    "NF-kB":     ["Cd47", "Cd38"],
}
print("논문 Fig 6H 의 모식도를 표로 옮기면")
print()
print("            Ddx54")
print("              |")
print("   +----------+----------+")
for i, (경로이름, 표적들) in enumerate(경로.items()):
    print(f"   |  {경로이름:<10} -> {' , '.join(표적들)}")
print()
print("Ddx54 하나가 세 경로를 통해 두 방패를 켭니다.")
print("그래서 Ddx54 를 끄면 두 방패가 함께 내려갑니다 - 이것이 '마스터 조절자' 입니다.")

🤔 Check yourself

CD47 이 면역을 피하는 방식은?

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CD38 이 T세포에 미치는 영향을 가장 정확히 말한 것은?

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CD47 이 38% 줄어든 것을 '시시하다' 고 보기 어려운 이유는?