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모든 측정은 맞바꿈입니다. 수를 얻으면 위치를 잃고, 위치를 얻으면 깊이를 잃습니다.
지금까지 배운 개념들은 재야 뜻이 생깁니다.
그런데 도구마다 보이는 것이 다릅니다.
| 도구 | 얻는 것 | 잃는 것 | 논문에서 | 강의 |
|---|
| H&E + 딥러닝 | 위치 · 아주 많은 환자 |
세포의 종류와 상태 | Fig 1 · 4E | /til |
| 유세포분석 | 정확한 개수 · 단백질 |
위치를 완전히 잃는다 | Fig 4F | /cytohist |
| 벌크 RNA-seq | 유전자 2만 개 전부 |
세포가 섞여 평균이 된다 | Fig 3 · 6 | /bio /bulk |
| 단일세포 RNA-seq | 세포마다 유전자 2만 개 |
위치 · 조직을 갈아야 한다 | Fig 5H-L · 7 | /immune |
| 공간전사체 | 위치 + 유전자 5천 개 |
유전자 수 · 세포당 깊이 | Fig 5A-G · 8 | /spatial |
논문이 다섯 가지를 다 쓴 이유가 여기 있습니다.
어느 하나도 혼자서는 "면역세포가 종양 안으로 들어왔다" 를 증명하지 못해요.
이 표가 논문의 그림 배치를 그대로 설명합니다.
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이 사이트의 강의 지도
지금 여러분이 듣는 강의는 말을 다뤘습니다.
그 말들을 자료로 확인하는 강의가 따로 있습니다.
이 강의에서 배운 말 하나하나가 저 강의들의 어느 강에 대응하는지
20강에서 표로 정리합니다.
🤔 Check yourself
유세포분석이 완전히 잃는 정보는?
Answer 유세포분석은 조직을 갈아서 단일세포 현탁액으로 만든 뒤 한 개씩 흘려 보냅니다. 그 순간 '어디 있었는지' 는 영영 사라집니다.
🤔 Check yourself
논문이 같은 종양을 H&E 와 유세포분석으로 두 번 센 이유는?
Answer 수렴 타당도입니다. 서로 다른 방식으로 재서 같은 답이 나올 때 결론이 단단해집니다.
🤔 Check yourself
공간전사체가 단일세포 RNA-seq 에 비해 잃는 것은?
Answer Xenium 은 미리 고른 5,006개 유전자만 봅니다. 전사체 전체(약 2만)를 보는 단일세포에 비해 시야가 좁고 얕습니다. 대신 위치를 얻어요.