19강 / 20강
【실습】 Table 1 을 다시 읽는다 — Drug Score 0.84 는 무엇인가
Table 1 「Active Site analysis of the Protein Ror1 using DogSiteScorer」
이 강은 손을 움직이는 강입니다. 논문 Table 1 을 열고 Drug Score 라는 숫자가 어디서 오는지를 되짚습니다.
DogSiteScorer 의 Drug Score 는 세 가지에서 만들어집니다 — 부피 · 소수성 표면 비율 · 폐쇄도(enclosure). 셋을 지지벡터머신으로 학습해 0~1 로 낸 값이에요.
그러니 Drug Score 는 "약이 붙을 만한 모양인가" 를 잽니다. "여기가 기능하는 자리인가" 는 재지 않습니다. 이 둘은 다릅니다.
두 순서가 거의 같습니다. 곧 Drug Score 는 부피가 거의 다 설명합니다.
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상관계수 넷을 나란히 놓으면 답이 보입니다. 부피가 대부분입니다.
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분모를 바꾸면 순위가 뒤집힙니다. P0 이 1등을 지키는지 확인해 보세요.
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주황 선이 세 계단 이상 움직인 주머니입니다. 순위가 분모에 따라 흔들린다면, 그 순위로 내린 결정도 흔들립니다.
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🤔 확인 문제
Drug Score 가 실제로 재는 것은?
해설 부피 · 소수성 · 폐쇄도로 붙을 만한 모양을 잽니다. 기능하는 자리인지는 재지 않아요 — 그건 진화 정보나 실험이 필요합니다.
🤔 확인 문제
Table 1 에서 Drug Score 와 가장 강하게 상관된 열은?
해설 부피입니다. 그래서 Drug Score 순위는 부피 순위와 거의 같아요. 큰 주머니 편향이 이 사슬 전체를 관통합니다.