권교수의 T세포 첫걸음

조각 몇백 개로
10⁸ 가지를 만드는 법

T세포 하나는 딱 하나만 알아봅니다. 그런데 몸에는 아직 만난 적 없는 병원체까지 알아볼 수용체가 준비되어 있어야 해요.
이 20강은 그 설계 문제를 만들기 → 고르기 → 읽기 세 단계로 풀어 갑니다. 그리고 개념만 말하지 않습니다 — 10x Genomics 가 공개한 실제 사람의 레퍼토리 네 표본, 세포 11,791개를 직접 열어 V 유전자 사용 · CDR3 길이 · 다양성 지표 · 클론 확장 · 공개 클론 · 항원 특이성을 여러분이 계산합니다.
자료만 보고 두 표본이 같은 사람인지 알아내는 실습도 있어요. 파이썬은 이 페이지 안에서 바로 실행됩니다.

⚔️ T세포🧬 V(D)J🔢 레퍼토리 📊 다양성 지표🐍 Python🦠 항원 특이성🇰🇷 한국어

1강 시작하기 →

이렇게 배웁니다

🔬진짜 레퍼토리로

가상 자료가 아닙니다. 10x Genomics 가 공개한 실제 사람 네 표본, 세포 11,791개의 수용체 서열을 그대로 씁니다. IMGT 배선 유전자 개수도 파일에서 직접 셉니다.

🕵️자료로 사람을 찾아낸다

네 표본 중 둘은 같은 사람입니다. 알려 주지 않습니다 — 11강에서 여러분이 알아냅니다. 그리고 그 방법이 왜 통하고 다른 방법은 왜 안 통하는지까지 봅니다.

📏속는 법을 먼저

세포 수가 다르면 다양성을 그대로 견줄 수 없습니다. 작게 보면 클론 확장이 사라집니다. 실패한 재조합은 자료에 없습니다. 안 보이는 것을 생각하는 훈련을 계속합니다.

✍️못 한 것을 적는다

18강에서 이 자료로 말할 수 있는 문장 여덟 개와 없는 문장 여섯 개를 근거와 함께 적습니다. 그리고 무엇을 더하면 X 가 O 가 되는지까지요.

전체 커리큘럼

하나만 알아보는 세포 — 그런데 10⁸ 가지

T세포 수용체의 설계 문제 · 이 20강이 푸는 것

V(D)J 재조합 — 유전자를 잘라 이어 붙인다

RAG 가 하는 일 · 조각 몇백 개가 몇 가지가 되나

【실습】 레퍼토리를 연다 — 한 줄이 사슬 하나

10x V(D)J 표를 읽는 법 · 무엇을 걸러 내야 하나

V 유전자 사용은 균일하지 않다

무작위라면서 왜 어떤 조각은 500배 더 쓰이나

CDR3 — 다양성이 모이는 자리

왜 이 짧은 구간 하나가 수용체의 정체를 정하나

【실습】 이음매 — 모자란 다양성을 여기서 채운다

잘라 내고 끼워 넣기 · 530만에서 10⁸ 까지

흉선 — 만든 것의 98%를 죽인다

양성선택과 음성선택 · 두 문턱 사이의 좁은 창

MHC 제한 — 왜 남의 MHC 는 못 읽나

수용체가 보는 것은 펩타이드가 아니라 펩타이드 + 접시

다양성을 숫자 하나로 — Shannon · 균등도 · Gini · D50

네 지표가 언제 같은 말을 하고 언제 어긋나나

【실습】 클론 크기 분포 — 대부분은 하나뿐이다

긴 꼬리 · 그리고 표본이 작으면 꼬리가 사라진다

【실습】 공개 클론 — 그리고 표본 하나의 정체

두 사람이 같은 수용체를 가질 수 있나 · 자료만으로 알아내기

【실습】 이 수용체는 무엇을 알아보나

VDJdb 와 대조하기 · 그리고 이 사람은 CMV 를 앓았다

CD4 아형 — 같은 세포가 정반대 일을 한다

Th1 · Th2 · Th17 · Tfh · 무엇이 운명을 정하나

조절 T세포 — 브레이크를 밟는 T세포

Foxp3 · 억제하는 네 가지 방법 · 그리고 암이 이용하는 법

CD8 세포독성 — 죽이는 방법 두 가지

퍼포린과 그랜자임 · 그리고 왜 한 세포가 여러 번 죽일 수 있나

기억 — 왜 두 번째가 빠른가

Tcm · Tem · Trm · 백신이 작동하는 원리

소진 — 들어왔는데 못 싸운다

TOX 와 후성유전학적 흉터 · 왜 항-PD1 이 절반에게만 듣나

레퍼토리로 말할 수 있는 것과 없는 것

이 20강에서 실제로 확인한 것을 줄마다 채점한다

【실습】 논문 Fig 8 을 이 눈으로 다시 본다

DDX54 논문의 T세포 · 18강까지 배운 것을 전부 대 본다

정리 — 수용체 하나에서 여기까지

20강에서 만든 도구 · 다음 걸음