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증명의 두 축 — mRNA 로 재나 단백질로 재나

논문 Figs. S7A·S7B (qPCR) 와 Fig. S9 (웨스턴블롯)

증명의 두 축 — mRNA 로 재나 단백질로 재나
"껐다" 는 주장입니다. 재서 보여 줘야 증명이 됩니다.

/perturb 에서 siRNA 를 넣고 shRNA 안정주를 만들었습니다. 그런데 정말 꺼졌을까요?

재는 방법이 둘 있습니다. 그리고 둘은 다른 것을 잽니다.

🧬 qRT-PCR — mRNA 를 잰다
빠르다 (하루)
정량이 정확하다
여러 유전자를 함께

다만 mRNA 가 줄어도 단백질은 남아 있을 수 있다
🧷 웨스턴블롯 — 단백질을 잰다
실제로 일하는 것을 본다
크기까지 확인된다
인산화 상태도 볼 수 있다

다만 이삼일 걸리고 정량이 거칠다

논문은 둘 다 했습니다. 그리고 각각 다른 자리에 썼어요.

무엇을 보려고방법논문
Ddx54 넉다운이 됐나qRT-PCRFigs. S7A · S7B
신호 경로가 꺼졌나웨스턴블롯Fig. S9 (Wnt · Jak-Stat3 · NF-κB · Myc)
CD38 · CD47 이 줄었나웨스턴블롯Figs. 3 · S8C · S12E/F

둘째 줄이 특히 중요합니다. 인산화된 단백질(p-STAT3 같은)은 mRNA 로는 볼 수 없어요 — mRNA 양이 그대로여도 인산기가 붙었는지 떨어졌는지가 달라지니까요.

무엇을 보려는지 고르면, 어느 방법을 써야 하는지 알려 줍니다.
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STAT3 의 인산화 상태가 변했는지 보려면 어떤 방법을 써야 할까요?