Lesson 19 of 20
【실습】 Fig. S9 를 읽는다 — 전체 블롯과 잘라낸 그림
논문 Fig. S9 「Full blots of western blot analysis used in this study」
논문 본문의 웨스턴블롯 그림은 대개 밴드 부분만 잘라낸 것입니다. 막 전체를 실으면 지면이 모자라니까요.
그런데 그렇게 자르면 가려지는 것이 생깁니다.
| 가려질 수 있는 것 | 왜 문제인가 |
|---|---|
| 다른 크기의 밴드들 | 항체가 특이적이지 않다는 증거일 수 있다 |
| 레인의 경계 | 서로 다른 젤에서 잘라 이어 붙였을 수 있다 |
| 배경의 얼룩 | 전사나 블로킹이 고르지 않았다 |
그래서 요즘 학술지는 전체 블롯을 부록에 싣도록 요구합니다. 이 논문의 Fig. S9 가 그것이에요.
Fig. S9. Full blots of western blot analysis used in this study
(A) Wnt pathway associated genes. (B) Jak-Stat3 pathway and Cd47 associated genes.
(C) NF-ĸB pathway and Cd38 associated genes. (D) cMyc pathway associated genes.
전체 블롯에서 확인할 것
1. 밴드가 예상 크기에 있나 — DDX54 는 약 100 kDa, GAPDH 는 약 37 kDa
2. 다른 밴드가 있나 — 있으면 항체의 특이성을 의심
3. 레인 사이에 이음매가 있나 — 있으면 밝혀야 한다
4. 로딩대조군이 고른가 — 한 레인만 옅으면 그 레인 전체를 의심
3번은 그 자체로 잘못은 아닙니다. 같은 실험을 여러 젤로 나눠 돌리는 일은 흔하니까요. 다만 이어 붙였다면 그렇다고 적어야 합니다 — 안 적으면 한 젤에서 나온 것처럼 오해하게 되니까요.
🤔 Check yourself
논문이 부록에 '전체 블롯'을 싣는 가장 큰 이유는?
Answer 자른 그림만으로는 항체가 특이적인지, 이어 붙인 것인지를 알 수 없습니다. 전체 블롯이 그 확인을 가능하게 해요.