16강 / 20강

Table S4 를 읽는다 — 항체 열넷과 네 경로

SI Table S4 「Antibodies used for western blot analysis」

논문 Table S4 에는 항체 열넷이 있습니다. 그런데 아무렇게나 모아 놓은 것이 아니에요. 경로별로 묶입니다.

이 목록이 곧 논문의 가설입니다 — "DDX54 가 Wnt · Jak-Stat3 · NF-κB · Myc 을 켜서 CD38 · CD47 을 올린다."

그리고 Fig. S9 의 네 패널이 그 네 경로와 정확히 대응합니다.

고등학생Table S4를 읽는다

항체 표에는 여러 정보가 들어 있습니다. 각각 이유가 있어요.

항체는 로트마다 성능이 다릅니다 — 그래서 번호가 중요합니다.

고등학생단클론과 다클론

다클론은 로트가 바뀌면 결과가 달라질 수 있습니다 — 그래서 로트를 기록합니다.

확인할 것	왜
종 반응성	마우스 단백질에 듣나 · 사람에도 듣나 — LLC1 과 A549 둘 다 써야 한다
용도	WB 용인가 · IHC 용인가 · 유세포용인가 — 같은 표적이어도 다르다
단클론/다클론	단클론은 특이적이고 일정, 다클론은 신호가 세지만 로트마다 다름
검증 자료	넉다운 세포에서 밴드가 사라지는지 — 가장 강한 검증

마지막 줄이 중요합니다. 이 논문은 Ddx54 넉다운 세포를 갖고 있으니, DDX54 항체를 그 세포에서 돌려 밴드가 사라지면 항체가 진짜라는 증거가 됩니다.

논문이 카탈로그 번호를 적어 두는 것도 이 때문이에요 — 같은 항체를 남이 살 수 있어야 재현이 됩니다.

고등학생항체 열넷과 네 경로

여러 항체를 쓰는 것은 경로 전체를 보려는 것입니다.

경로의 위와 아래를 다 보면 인과 순서를 추정할 수 있습니다.

상류가 안 변했는데 하류가 변했다면, 다른 입력이 있다는 뜻이에요.

🤔 확인 문제

논문이 항체의 회사와 카탈로그 번호를 표로 싣는 가장 큰 이유는?