11강 / 20강

유전 근거는 있다 — 다른 병을 가리킬 뿐이다

EGLN1 의 1등 질환은 적혈구증가증 · genetic_association 0.87

7강에서 이렇게 말했습니다 — 콩팥병에서 PHD 세 아형에는 genetic_association 칸이 없다고요.

그러면 이 유전자들에는 사람 유전 근거가 아예 없는 걸까요? 확인해 봅시다. 이번에는 병에서 표적을 보는 것이 아니라, 표적에서 병을 봅니다.

EGLN1 의 1등 질환을 보세요. 그리고 그 줄의 근거 칸을 보세요.

Python 브라우저에서 실행

import ot

t = ot.target("EGLN1")
print("EGLN1 과 이어진 질환 : %d 개" % t["n_diseases"])
print()
print("%-42s %7s   %s" % ("질환", "점수", "무슨 근거로"))
print("-" * 84)
for r in t["top_diseases"][:6]:
    kinds = ", ".join("%s %.2f" % (k, v) for k, v in sorted(r["dt"].items()))
    print("%-42s %7.3f   %s" % (r["name"][:42], r["score"], kinds))

1등은 가족성 적혈구증가증 3형입니다. 그리고 그 줄에는 genetic_association 0.87 이 있습니다.

즉 사람 유전 근거는 있습니다. 다만 그것이 가리키는 병이 콩팥병도 장질환도 아니라 피가 진해지는 병입니다.

고등학생적혈구증가증이란

적혈구가 정상보다 많아지는 상태입니다. 피가 진해져서 혈전 위험이 올라가요.

원인	기전
EGLN1 기능 저하 변이	PHD가 약해짐 → HIF가 안 꺼짐 → EPO 증가 → 적혈구 증가
VHL 변이	같은 회로의 다른 지점
고산 거주	실제 저산소

이건 2강의 회로를 그대로 뒤집은 것입니다. PHD가 약해지면 HIF가 켜진 채 남고, EPO가 늘고, 적혈구가 늘어요.

적혈구가 많아지는 사람들

EGLN1 이 제대로 일하지 않는 사람이 있습니다. 그러면 HIF 가 늘 조금씩 켜져 있고, HIF 가 켜지면 적혈구생성인자(EPO) 가 나옵니다. 그래서 적혈구가 많아집니다.

이런 사람들이 실제로 보고돼 있습니다. 예를 들어 최근 사례 보고 하나는 어머니와 아들이 같은 EGLN1 변이(c.806T>C, p.Ile269Thr)를 가지고 평생 적혈구가 많았다고 적고 있습니다.
Ananthaneni A, et al. BMJ Case Rep 19(8):e272167 (2026)

더 오래된 이야기도 있습니다. 러시아 추바시 지방에는 VHL 유전자에 같은 변이(R200W)를 물려받아 적혈구가 많은 사람들이 모여 삽니다. 산소 감지 장치의 고장이 사람에게 무엇을 하는지 처음 보여 준 사례입니다.
Gordeuk VR, et al. Blood 103:3924–3932 (2004) · PMID 14726398

더 나아간 이야기도 있습니다. 티베트 사람들입니다.

해발 4,000 m 에서 오래 산 집단은 산소 감지 장치의 유전자에 다른 형을 가지고 있습니다. 2010년에 50명의 엑솜을 읽은 연구가 EPAS1(HIF-2α)에서 아주 강한 자연선택의 흔적을 찾았습니다.

Yi X, et al. Sequencing of 50 human exomes reveals adaptation to high altitude. Science 329:75–78 (2010) · PMID 20595611

재미있는 것은 방향입니다. 티베트 사람들은 고지대에서 적혈구가 덜 올라갑니다 — 피가 너무 진해지면 오히려 위험하니까요. 같은 장치를 다르게 조율한 것입니다.

고등학생이 유전 근거가 콩팥병 표적에 주는 것

병 이름은 다르지만, 이 유전 증거는 PHD 억제제에 결정적인 정보를 줍니다.

알려 주는 것	약 개발에서의 뜻
PHD가 약해지면 적혈구가 는다	약이 실제로 들을 것 — 인체 증거
그 사람들이 살아 있다	PHD를 부분 억제해도 치명적이지 않음
혈전 위험이 올라간다	주된 부작용을 미리 알려 줌
방향이 명확	막으면 EPO가 는다 — 억제제가 맞음

유전 증거는 "자연이 이미 해 놓은 인체 실험"입니다 (/gwas 1강).

즉 콩팥병 빈혈에 PHD 억제제를 쓰는 논리의 뿌리가 여기 있습니다. 적혈구증가증 환자들이 살아 있는 증명이에요.

여기까지를 정리하면 이렇습니다.

사람 유전학이 말해 주는 것

이 장치를 건드리면 적혈구가 변한다.
사람에게서 여러 번 확인됐습니다.
그래서 빈혈약이 됐습니다.

말해 주지 않는 것

이 장치를 건드리면 대장 염증이 낫는다.
이것을 뒷받침하는 사람 유전 근거는
이 자료에 없습니다.

그러니 회사의 선택은 사람 유전학에서 나온 것이 아닙니다. 그럼 어디서 나왔을까요. 다음 강이 답입니다.

EGLN2 를 눈여겨보세요. 다음 강에서 이 유전자가 주인공이 됩니다.

Python 브라우저에서 실행

import ot

# 세 아형 각각, 유전 근거가 붙은 질환이 몇 개나 되는지
for g in ["EGLN1", "EGLN2", "EGLN3"]:
    t = ot.target(g)
    gen = [r for r in t["top_diseases"] if "genetic_association" in r["dt"]]
    print("%-6s 상위 25개 질환 중 사람 유전 근거가 붙은 것 : %d 개" % (g, len(gen)))
    for r in gen[:3]:
        print("        %.3f  %s" % (r["dt"]["genetic_association"], r["name"][:50]))
    print()

고등학생그런데 점수판은 이걸 못 담는다

Open Targets에서 EGLN1의 genetic_association 점수는 적혈구증가증에 붙습니다. 콩팥병에는 안 붙어요.

사람의 추론	자료베이스의 처리
PHD 약화 → EPO 증가 → 콩팥병 빈혈에 유용	EGLN1 ↔ 적혈구증가증 (끝)
병 A의 기전이 병 B의 치료가 됨	병마다 따로 계산

"병을 일으키는 유전자"와 "그 병의 반대 방향이 치료가 되는 유전자"를 자료베이스는 구분하지 않습니다.

이것이 점수판의 구조적 한계입니다. 사람은 "적혈구가 너무 많아지는 병이 있다면, 적혈구가 부족한 병에 쓸 수 있겠다"고 추론하지만, 표는 그 연결을 못 만들어요.

19강에서 이런 근거를 손으로 넣게 됩니다.

🤔 확인 문제

EGLN1 과 가장 강하게 이어진 질환과 그 근거는?

🤔 확인 문제

이 강의 결론을 가장 정확히 말한 것은?