자료가 못 고르는 표적을
회사는 왜 골랐나
어느 제약회사의 공개 파이프라인에 이런 줄이 있습니다 — “PHD 억제제, 염증성 장질환과 만성콩팥병 치료”. 그런데 공개 자료를 두드려 보면 그 표적은 장질환과 이어진 표적 7,629개 중 상위 500 안에 없습니다. 논문은 한 편입니다.
이 20강에서는 Open Targets · ChEMBL · ClinicalTrials.gov · PubMed 를 직접 두드려 그 표적이 몇 등인지, 그 등수를 무엇이 지고 있는지, 그리고 표 밖에 무슨 근거가 있는지를 재어 봅니다. 파이썬은 이 페이지 안에서 바로 실행됩니다. 설치할 것은 없습니다.
이렇게 배웁니다
🧭한 줄에서 시작합니다
회사가 공개한 파이프라인의 한 줄이 재료입니다. 표적 이름 하나뿐인 그 줄에서 출발해, 약 이름 · 임상 단계 · 규모 · 시작일까지 공개 자료만으로 알아냅니다.
🗄️진짜 API 를 두드립니다
대리 자료가 아닙니다. Open Targets · ChEMBL · ClinicalTrials.gov · PubMed 의 실제 응답을 그대로 실었고, 함수 이름과 JSON 모양이 진짜 API 와 같습니다.
🔬점수를 뜯어봅니다
"14등" 이라는 숫자가 무엇으로 만들어졌는지 칸칸이 나눕니다. 한 칸을 빼면 400등이 됩니다. 순위를 읽는 것과 믿는 것은 다른 일입니다.
✍️빈칸을 비워 둡니다
이 강의가 답하지 못하는 칸을 마지막 강에 그대로 찍습니다. 지어낸 값을 순위에 섞지 않는 것 — 그것이 이 강의의 규칙입니다.
전체 커리큘럼
01
한 줄이 두 병을 가리킨다
insilico.com/pipeline 세 번째 칸 · 받은 날 2026-08-30
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02
몸에는 산소를 재는 눈금자가 있다
HIF · VHL · PHD — 2019년 노벨 생리의학상
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03
센서가 산소를 재는 방법 — 산소를 써 버린다
PHD 세 아형 EGLN1 · EGLN2 · EGLN3 · Open Targets 표적 기록
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04
표적을 고르는 여섯 가지 논리 — PHD 는 어느 칸인가
/insilico 4강의 여섯 칸을 이 표적에 대어 본다
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05
병 하나에 표적이 칠천 개 붙어 있다
Open Targets Platform · MONDO_0005300 · 연관 표적 7,008개
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06
콩팥병에서 PHD 는 14등이다
EGLN1 · EGLN2 · EGLN3 = 14 · 15 · 16등 / 7,008개
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07
셋의 점수가 소수점 셋째 자리까지 같다
clinical = 0.936 · 0.936 · 0.936
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08
한 칸을 빼면 14등이 400등이 된다
clinical 근거를 걷어 내고 다시 줄 세우기
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09
같은 표적, 다른 병 — 장질환에서는 목록에 없다
IBD 7,629개 · UC 7,161개 · 상위 500 안에 EGLN 셋 다 없음
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10
논문을 센다 — 장질환과 함께 나온 것은 한 편이다
PubMed E-utilities · EGLN1 x IBD = 1편 · EGLN2 = 0 · EGLN3 = 0
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11
유전 근거는 있다 — 다른 병을 가리킬 뿐이다
EGLN1 의 1등 질환은 적혈구증가증 · genetic_association 0.87
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12
장은 원래 저산소다 — 표 밖에 있던 근거
Tambuwala MM, et al. Gastroenterology 139:2093–2101 (2010) · PMID 20600011
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13
약 쪽 자료를 연다 — 측정값 3,879건
ChEMBL REST · EGLN1 2,994 · EGLN2 656 · EGLN3 205
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14
약 여섯 개를 세 아형에 대어 본다 — 대부분 빈칸이다
ChEMBL 활성 · 록사두스타트 · 바다두스타트 · 다프로두스타트 외 3종
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15
측정값 0건짜리 칸이 순위를 만들었다
CHEMBL3831261 · PROTEIN FAMILY · 활성 0건
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16
같은 계열인데 하나는 미국에 라벨이 없다
openFDA drug label · 다프로두스타트 O · 바다두스타트 O · 록사두스타트 X
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17
같은 기전으로 먼저 간 약이 있다 — 236명에서 멈췄다
NCT04556383 · GB004 · 궤양성대장염 2상 · TERMINATED
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18
세상에 딱 한 건 — 그 시험을 찾아낸다
NCT07265570 · ISM5411 · 2a상 · 80명 · 중국 28기관 · 2025-12-10 시작
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19
실습 종합 — 점수판을 내 손으로 다시 짠다
근거 종류에 가중치를 직접 주고 7,008개를 다시 줄 세운다
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20
정리 — 말할 수 있는 것과 말할 수 없는 것
그리고 이 꾸러미들을 진짜 인터넷에 연결하는 법
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