안정주 — 풀로 쓸까, 클론을 딸까

선별이 끝나면 살아남은 세포들이 있습니다. 그런데 이 세포들은 똑같지 않습니다.

바이러스가 게놈의 어디에 꽂히는지는 세포마다 다르거든요. 꽂힌 자리에 따라 shRNA 가 얼마나 만들어지는지도 다릅니다.

논문은 CRISPR 에서 풀을 명시했습니다 — Puromycin-selected and pooled stable cells.

클론을 따면 '그 클론이 원래 이상했던 것 아니냐' 는 반문이 생깁니다. 풀은 그 반문을 막아 줍니다.

Day 7 과 Day 11 — 왜 두 번 재나

논문 Fig. S7B 는 넉다운을 두 시점에서 확인합니다.

shRNA 는 siRNA 와 달리 오래갑니다(7강). 그런데 정말 오래가는지를 보여 줘야 합니다 — 특히 3주짜리 동물실험에 쓸 것이니까요.

Day 7 과 Day 11 에서 모두 넉다운이 유지된다면, 그 세포를 마우스에 넣어도 기간 내내 꺼져 있을 것이라고 믿을 근거가 됩니다.