7강 / 20강
【실습】 Fig. S7A 를 읽는다 — 넉다운 효율 %
논문 Fig. S7A 「Results of Ddx54 knockdown in the LLC1 cell line using siRNA」
논문 Fig. S7A 는 siRNA 로 Ddx54 를 얼마나 껐는지 보여 주는 막대그림입니다. 이런 그림을 읽을 때 확인할 것이 셋 있습니다.
| 확인할 것 | 왜 |
|---|---|
| 기준(1.0)이 무엇인가 | 스크램블인가, 무처리인가 — 다르면 값이 달라진다 |
| 몇 % 남았나 | "껐다" 는 말은 0% 를 뜻하지 않는다 |
| mRNA 인가 단백질인가 | 둘은 다르게 움직인다 (다음 강) |
보통 70~90% 감소면 좋은 넉다운으로 봅니다. 즉 10~30% 는 남아 있습니다.
두 siRNA 의 값이 조금 다른 것은 정상입니다. 겨냥한 자리가 다르니까요.
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🤔 확인 문제
Fig. S7A 같은 넉다운 효율 그림에서 반드시 확인해야 하는 것은?
해설 기준이 무엇이냐에 따라 같은 자료가 다른 %로 보입니다. 논문은 스크램블을 기준으로 씁니다(4강).