18. 상용기의 70% — 이 숫자를 어떻게 읽을 것인가 · 유박사의 mRNA 즉석 합성기 첫걸음 I

이 논문에서 유일하게 상용 장비와 정면으로 견준 자리입니다.

레인	무엇
prototype	이 상자가 만든 mRNA-LNP
PNI	Precision Nanosystems Ignite — 상용 LNP 장비로 만든 것
MOCK	아무것도 안 넣은 대조

293T 세포에 넣고 24시간 뒤 RBD 단백질을 웨스턴 블롯으로 봅니다. ImageJ 로 띠의 회색값을 재고 β-actin 으로 보정합니다. 결과는 상용기의 약 70%.

밴드 정량의 불확실성을 직접 흔들어 보세요. 70% 라는 값이 얼마나 단단한지 감이 잡힙니다.

불러오는 중…

밴드 정량의 변동을 넣고 돌려 봅니다. 70%%라는 숫자에 붙는 구간이 얼마나 넓은지 봅니다.

Python 브라우저에서 실행

# 웨스턴 블롯 정량의 오차는 크다. 70% 라는 값에 붙는 구간을 거칠게 가늠해 본다.
import numpy as np
rng = np.random.default_rng(17)

true_ratio = 0.70
cv_band    = 0.20        # 밴드 농도 측정의 흔한 변동계수 (노출·배경·포화)

print("%6s %28s" % ("n", "관측 비율의 90% 구간"))
for n in (1, 3, 5, 10):
    obs = []
    for _ in range(20000):
        p = rng.normal(1.0, cv_band, n).mean()
        q = rng.normal(true_ratio, cv_band * true_ratio, n).mean()
        obs.append(q / p)
    lo, hi = np.percentile(obs, [5, 95])
    print("%6d %16.0f%% ~ %8.0f%%" % (n, lo * 100, hi * 100))
print()
print("논문은 n 을 밝히지 않았다. n=1 이면 구간은 40%~110% 다.")
print("→ '70%' 는 자릿수를 말할 뿐, 30% 차이를 논할 근거는 되지 못한다.")

웨스턴 블롯을 정량으로 쓸 때 조심할 것

📸

포화

진한 띠는 필름·카메라가 더 이상 진해지지 못합니다. 진짜 차이가 눌립니다

🌫️

배경

배경을 어디서 빼느냐로 값이 흔들립니다. ImageJ 는 사람이 사각형을 그립니다

📐

선형 구간

항체 신호가 양에 비례하는 구간은 좁습니다. 그 밖에서는 비율이 뜻을 잃습니다

그래서 관례는 이렇습니다. 웨스턴 블롯은 “있다/없다” 와 “대략 몇 배” 까지. 정밀한 비율이 필요하면 ELISA 나 루시페라제 같은 수치가 나오는 검정으로 갑니다 — II권이 실제로 그렇게 합니다(루시페라제 발광량).

🤔 확인 문제

“상용기의 70%” 라는 결과를 가장 정직하게 옮긴 문장은?

🤔 확인 문제

이 비교 실험의 설계상 한계는?