17강 / 20강

Xenium 절차 열한 단계 — 절편에서 이미지까지

SI Xenium 문단 · 5 µm · 42 °C · DV200 · 자가형광 소광

Xenium 절차 열한 단계 — 절편에서 이미지까지
앞 과목에서 배운 것들이 여기서 다시 나옵니다.

논문의 Xenium 문단은 절차를 아주 자세히 적었습니다. 그런데 앞부분은 이미 배운 것입니다.

단계어디서 배웠나
FFPE 블록/cytohist 14강
마이크로톰 5 µm/cytohist 15강
42 °C 수조에 띄워 주름 펴기/cytohist 15강
파라핀 빼기 (deparaffinization)/cytohist 16강
DAPI · H&E 로 품질 확인/cytohist 16강
DV200 > 30%이 강의 3강
프로브 혼성화 · 결찰 · 증폭이 강의 16강

같은 5 µm, 같은 42 °C 입니다. 조직학의 손기술이 그대로 공간전사체의 앞단이 되는 것이죠.

열한 단계를 하나씩 밟아 보세요.
불러오는 중…

Xenium 만의 두 단계

📐
fiducial 피하기
슬라이드에 기준점이 찍혀 있다.
조직으로 가리면 안 된다
🌑
자가형광 소광
조직이 스스로 내는 빛을
하이드로설파이트로 지운다

fiducial 은 슬라이드에 미리 찍힌 표시입니다. 기기가 여러 번 사진을 찍을 때(16강 5단계) 같은 자리를 정확히 다시 찾아야 하는데, 그 기준이 되는 점이에요. 조직으로 덮어 버리면 정렬이 안 됩니다.

자가형광은 조직 자체가 내는 빛입니다. 적혈구, 지질, 콜라겐, 그리고 포르말린 고정 자체가 형광을 만들어요. 그 배경 위에서는 진짜 신호를 가릴 수 있어 미리 지웁니다.

🤔 확인 문제
Xenium 슬라이드의 fiducial 을 조직으로 가리면 안 되는 이유는?