4강 / 20강
네 가지를 견준다 — 무엇을 알고 싶으냐가 방법을 정한다
bulk · small RNA · 10x · Xenium
논문의 네 라이브러리를 무엇을 얻고 무엇을 잃는지로 견줘 봅시다.
| bulk | small RNA | 10x 단일세포 | Xenium | |
|---|---|---|---|---|
| 세포 하나하나 | ❌ 평균 | ❌ 평균 | ✅ | ✅ |
| 조직 안 위치 | ❌ | ❌ | ❌ 갈아서 잃음 | ✅ |
| 유전자 전체 | ✅ | miRNA 만 | ✅ | ❌ 5,000개 패널 |
| 비용 | 싸다 | 싸다 | 비싸다 | 아주 비싸다 |
| 필요한 RNA | 많음 | 많음 | 살아 있는 세포 | FFPE 절편 |
세 번째 줄이 중요합니다. Xenium 은 미리 정한 5,000개 유전자만 봅니다 — 프로브를 만들어 붙이는 방식이라 목록이 정해져 있어요(17강).
그래서 새로운 유전자를 발견하는 데는 못 씁니다. 이미 아는 유전자가 어디에 있는지를 보는 도구예요.
🤔 확인 문제
Xenium 으로는 할 수 없는 것은?
해설 Xenium 은 프로브로 읽습니다. 프로브가 없는 유전자는 볼 수 없어요. 5,000개 패널에 든 것만 봅니다.