1강 / 20강
FASTQ 는 하늘에서 떨어지지 않는다
논문이 만든 네 가지 라이브러리 · 이 20강의 지도
/bulk · /mirna · /immune · /spatial —
네 건식 강의는 모두 파일 하나에서 시작합니다. FASTQ 예요.
그런데 그 파일이 어디서 왔는지는 다루지 않습니다. 이 20강이 그 빈자리를 채웁니다.
가운데 칸이 이 강의입니다.
논문이 만든 네 가지
| 라이브러리 | 무엇을 읽나 | 시퀀서 | 이어지는 강의 |
|---|---|---|---|
| bulk 3′ mRNA-seq | 세포 덩어리의 mRNA | HiSeq 2500 | /bulk |
| small RNA-seq | miRNA (약 22 nt) | NextSeq550 | /mirna |
| 10x 5′ 단일세포 | 세포 하나하나의 mRNA | HiSeq 2500 | /immune |
| Xenium 인시츄 | 조직 안 위치별 mRNA | Xenium Analyzer | /spatial |
넷 다 RNA 를 읽는 일인데 방법이 전혀 다릅니다. 무엇을 알고 싶으냐가 방법을 정하기 때문이에요.
그리고 마지막 하나는 시퀀싱이 아닙니다 — 현미경으로 찍습니다(16강).
🤔 확인 문제
이 강의가 다루는 구간은 어디일까요?
해설 RNA 추출은
/molassay, FASTQ 분석은 /bulk 등이 다룹니다. 이 강의는 그 사이예요.