1.6 이라는 금 — 29,620 에서 1,443 이 남는다

이 강의에서 가장 중요한 숫자 하나를 꼽으라면 1.6 입니다.

논문은 집단 적용범위를 계산하기 위해 목록을 줄여야 했습니다. 그때 쓴 금은 퍼센타일 순위 ≤ 1.6 이었습니다. 이 금 하나로

스무 배와 쉰일곱 배가 줄었습니다. 금 하나입니다.

29,620 은 “서로 다른 펩타이드 29,620개” 가 아니다

여기서 많이들 오해합니다. 스파이크 단백질은 1,273 아미노산입니다. 거기서 잘라 낼 수 있는 9 아미노산 조각은 몇 개일까요.

1,265 개뿐입니다. 그런데 예측 결과는 29,620 줄입니다. 스무 배가 넘습니다. 왜냐하면 결과의 한 줄은 펩타이드 하나가 아니라 펩타이드 × HLA 대립유전자 짝 하나이기 때문입니다.

같은 펩타이드가 여러 줄에 나오면 무슨 일이 생기나

좋은 일입니다. 한 펩타이드가 여러 HLA 에 붙는다는 뜻이니까요. 그런 펩타이드는 더 많은 사람에게서 쓰일 수 있습니다.

그리고 이것이 10·11강에서 볼 평균 히트 5.18 과 PC90 3.39 의 뿌리입니다. 한 사람이 여러 에피토프–HLA 조합을 알아보는 것은, 한 에피토프가 여러 HLA 에 붙기 때문입니다.