15. 함정 하나 — 종이 다르고 이형이 다르고 판이 낡았다

가장 위험한 오류는 프로그램이 멈추는 오류가 아닙니다. 멈추면 고칩니다. 위험한 것은 끝까지 잘 돌아가는 오류입니다.

Step 1 에서 그런 오류가 셋 있습니다.

함정	어떻게 생기나	왜 안 걸리나	어떻게 잡나
종이 다르다	이름으로 검색해서 비슷한 바이러스 것을 받음	서열 형식이 정상	머리글의 종 칸 · 주소 대조
이형이 다르다	같은 유전자의 다른 산물을 받음	길이도 그럴듯하다	길이 1273 검산
판이 낡았다	예전에 받아 둔 파일을 다시 씀	모든 검사를 통과	판 번호 기록 (10강)

함정 하나를 골라 보세요. 그 오류가 어느 걸음까지 살아남고, 어디에서 결과를 뒤집는지 따라갑니다.

불러오는 중…

검사 하나를 빼면 정확히 그 함정 하나가 통과합니다.

Python 브라우저에서 실행

# 세 함정을 흉내 내고, 어떤 검사가 각각을 잡아내는지 표로 만든다.
# 길이 값 가운데 1273 만 논문에서 온 것이고 나머지는 함정을 보이기 위한 모형이다.
cases = [
    ("올바른 것",   1273, "SARS-CoV-2", "YP_009724390.1"),
    ("종이 다름",   1255, "다른 코로나바이러스", "YP_XXXXXXXXX.1"),
    ("이형이 다름", 1140, "SARS-CoV-2", "YP_009724390.1"),
    ("판이 낡음",   1273, "SARS-CoV-2", "YP_009724390"),
]

TRUE_LEN, TRUE_SP = 1273, "SARS-CoV-2"

print("%-12s %6s %-22s %-18s %s" % ("무엇", "길이", "종", "주소", "잡히는 검사"))
for name, L, sp, acc in cases:
    caught = []
    if L != TRUE_LEN:
        caught.append("길이")
    if sp != TRUE_SP:
        caught.append("종")
    if "." not in acc:
        caught.append("판번호")
    print("%-12s %6d %-22s %-18s %s"
          % (name, L, sp, acc, " + ".join(caught) if caught else "없음 - 통과"))
print()
print("'종이 다름' 은 길이로도 종으로도 잡힌다 - 검사 둘이 걸린다.")
print("'이형이 다름' 은 길이 하나로만 잡힌다 - 길이 검사를 빼면 끝까지 간다.")
print("'판이 낡음' 은 길이도 종도 맞다. 판 번호를 적어 두지 않았다면 영영 모른다.")

가장 무서운 것은 셋째다

종과 이형은 길이로 대개 걸립니다. 그런데 낡은 판은 다릅니다.

낡은 판의 특징

길이가 같을 수 있다 · 종이 같다 · 주소가 같다 · 글자 몇 개만 다르다

결과

에피토프 하나가 조용히 사라지거나 생깁니다. 전체 결과는 그럴듯하고, 왜 남과 다른지 설명할 길이 없습니다

막는 방법은 하나뿐입니다 — 판 번호와 내려받은 날짜를 적어 두는 것. 그래서 10강이 이 강의에 있습니다.

검사를 언제 도나

세 검사는 서열을 받은 직후에 답니다. Step 2 로 넘긴 뒤에 돌리면 늦습니다 — 그때는 이미 에피토프 목록이 나와 있고, 그 목록이 그럴듯해 보여서 의심할 마음이 사라집니다.

언제	드는 비용	고치기
서열을 받은 직후	몇 초	주소를 다시 친다
Step 2 를 마친 뒤	몇 십 분	Step 2 를 다시 돈다
Step 5 를 마친 뒤	2~3시간 (18강)	전부 다시 돈다
논문을 낸 뒤	—	정정문

🤔 확인 문제

Step 1 의 오류 가운데 가장 잡기 어려운 것은?

🤔 확인 문제

Step 2 의 도구가 엉뚱한 서열을 받고도 결과를 내놓는 까닭은?

🤔 확인 문제

길이 검산(1273)을 빼면 통과해 버리는 함정은?