1강 / 20강

표적 하나가 나머지 다섯 걸음을 정한다

Step 1 · Fig. 4 의 첫 칸

표적 하나가 나머지 다섯 걸음을 정한다
여섯 칸 가운데 첫 칸입니다. 첫 칸이 틀리면 뒤의 다섯 칸은 정확하게 틀립니다.

백신을 설계한다는 말은 결국 어떤 단백질을 몸에 보여 줄 것인가를 정하는 일입니다. 그 단백질을 표적(target) 이라고 부릅니다.

이 논문은 표적 하나를 예제로 끝까지 따라갑니다. SARS-CoV-2 의 스파이크 단백질입니다. 그리고 그 표적을 정하는 일에만 걸음 하나를 따로 떼어 놓았습니다. 그게 Step 1 이고, 이 강의 전부입니다.

표적을 고르는 일은 계산이 아니라 결정이다

계산은 되돌릴 수 있습니다. 결정은 그 위에 쌓인 것을 전부 무너뜨려야 되돌릴 수 있습니다. 그래서 첫 칸입니다.

여섯 걸음 가운데 우리는 첫 칸에 있다

걸음하는 일들어가는 것이 강의와의 관계
Step 1표적 지정 · 서열 확보질문 하나여기
Step 2도메인 · 모티프 · 에피토프 주석단백질 서열1강의 산출물을 받는다
Step 3거르기 · 다중 에피토프 구조체 설계에피토프 목록—
Step 4코돈 최적화 · RNA 구조아미노산 서열—
Step 5인실리코 검증 (가상 클로닝 · 면역 시뮬레이션)최적화된 서열—
선택비번역 부위 · 뉴클레오사이드 변형구조체—

Step 2 는 Step 1 이 내놓은 서열 한 줄을 받아서 시작합니다. 그 한 줄이 엉뚱한 종의 것이면, Step 2 는 엉뚱한 종의 에피토프를 아주 정밀하게 찾아냅니다. 오류가 계산으로 걸리지 않습니다.

첫 칸의 결정 하나를 골라 보세요. 그 결정이 뒤의 어느 걸음을 어떻게 뒤집는지 따라 내려갑니다.
불러오는 중…
오류가 조용히 번집니다. 어느 단계에서도 프로그램이 멈추지 않습니다.
Python 브라우저에서 실행

이 강의가 끝나면 손에 남는 것

🗂️
주소 한 벌
단백질 · 염기 · 유전자 · 구조 네 가지 접근번호를 짝지어 적은 기록표
🧾
검산 셋
길이 · 좌표 · 판 번호. 세 자리가 서로 맞아야 다음 걸음으로 간다
🚦
갈림길 하나
표적을 아는가 모르는가. 모르면 12~14강의 훑기 경로로 간다

한 강 = 한 결정

이 사이트의 다른 강의와 마찬가지로, 강마다 정해지는 것 하나가 있습니다. 그리고 그것을 다르게 정하면 무엇이 뒤집히는지 함께 적습니다.

강정하는 것다르게 정하면
3어느 문으로 들어가나받는 것이 단백질이냐 좌표까지냐가 갈린다
6좌표를 1 부터 세나 0 부터 세나서열이 한 글자 밀린다
8정지코돈을 길이에 넣나3819 냐 3822 냐가 갈린다
10판 번호를 적나 안 적나몇 달 뒤 같은 결과가 안 나온다
17전장이냐 다중 에피토프냐넓이와 변이 대응 속도가 뒤바뀐다
🤔 확인 문제
Step 1 에서 엉뚱한 종의 서열을 받아 왔다면 어떤 일이 생기나요?
🤔 확인 문제
이 강의(Step 1)의 산출물을 가장 정확하게 말한 것은?
🤔 확인 문제
이 논문의 수치를 인용할 때 반드시 함께 적어야 하는 것은?