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대부분의 GWAS 히트는 작습니다. 그런데 가끔 이런 것이 나와요.
5강에서 오즈비 중앙값이 1.14 라고 했습니다. 그런데 예외가 있어요.
특발성 폐섬유증(IPF)의 카탈로그 결과를 p 순으로 뽑아 봤습니다.
/geo 강의에서 다룬 바로 그 병입니다.
| 유전자 | SNP | p | 오즈비 | 자리의 종류 |
MUC5AC - MUC5B | rs35705950 | 9×10⁻⁴¹⁸ | 5.06 | splice_region |
MUC5AC - MUC5B | rs35705950 | 1×10⁻³²³ | — | splice_region |
DSP | rs2076295 | 2×10⁻⁴⁸ | 1.49 | intron |
TERT | rs7725218 | 5×10⁻³² | 1.41 | intron |
p = 9×10−418
지수가 −418 입니다. 우주의 원자 수가 10⁸⁰ 개쯤이에요.
그럼 MUC5B 를 막는 약을 만들면 될까요? 여기서 이 강의의 어려운 부분이 시작됩니다.
유전 증거는 거의 완벽하다
· 효과가 크다 (OR 5.06)
· 여러 인구에서 되풀이됐다
· 방향이 분명하다 (발현 증가 → 위험 증가)
· 자리도 분명하다 (프로모터)
그런데
· MUC5B 변이를 가진 IPF 환자가 더 오래 삽니다
· 점액은 기도를 지키는 일도 합니다 — 막으면 감염이 늘 수 있어요
· 발병에 관여하는 것과 진행에 관여하는 것이 다를 수 있습니다
강한 증거가 반드시 좋은 표적은 아닙니다.
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🤔 Check yourself
rs35705950(MUC5B) 이 GWAS 히트로서 예외적인 이유는?
Answer 카탈로그의 오즈비 중앙값은 1.14 입니다. 5.06 은 흔한 변이로는 아주 드문 크기예요.
🤔 Check yourself
MUC5B 변이가 발병 위험은 크게 높이면서 진행은 느리게 하는 현상이 주는 교훈은?
Answer 약은 이미 걸린 사람에게 씁니다. 발병 위험 유전자와 진행 유전자가 같으리라는 보장이 없어요.