5. 너비가 뜻을 나른다 — 6~15 와 20~50 · 손박사의 mRNA백신 설계 첫걸음 II

논문이 너비를 6~50 아미노산으로 잡은 데에는 까닭이 있습니다. 그 범위 안에서 길이가 다르면 대개 종류가 다르기 때문이에요.

너비	대개 무엇인가	왜 중요한가
6~15 아미노산	수용체와 붙는 자리, 면역 활성과 관련된 짧은 무늬	에피토프와 길이가 겹친다 → 백신에 바로 쓸 후보
20~50 아미노산	융합펩타이드, 헵타드 반복 같은 구조요소	구조를 지탱하는 자리 → 건드리면 접힘이 망가질 수 있다

그물코 크기

그물코가 크면 큰 물고기만 걸리고 작은 것은 다 빠져나갑니다. 그물코가 작으면 작은 것도 걸리지만 쓰레기도 같이 걸려요.

너비 설정이 딱 그렇습니다. 6 까지 내리면 짧은 무늬를 잡지만 우연한 되풀이도 훨씬 많이 올라옵니다(4강에서 본 그것).

너비 범위를 좁혔다 넓혔다 해 보세요. 잡히는 종류가 달라집니다.

불러오는 중…

너비를 열어 둘수록 훑는 자리가 늘고, 우연히 그럴듯한 것도 함께 늘어납니다.

Python 브라우저에서 실행

# 너비를 바꾸면 훑는 자리 수가 어떻게 달라지나
L = 1273

print("너비   훑는 자리 수")
for w in (6, 9, 15, 20, 30, 50):
    print(" ", w, "      ", L - w + 1)

narrow = sum(L - w + 1 for w in range(6, 16))
wide   = sum(L - w + 1 for w in range(20, 51))
print()
print("너비 6~15 를 다 훑으면 :", narrow, "자리")
print("너비 20~50 을 다 훑으면:", wide, "자리")
print("6~50 을 통째로 열면    :", sum(L - w + 1 for w in range(6, 51)), "자리")

위 숫자가 4강의 교훈과 만납니다. 훑는 자리가 많아질수록 우연히 유의해 보이는 무늬도 늘어납니다. 너비를 넓게 여는 것은 공짜가 아니에요.

🤔 확인 문제

모티프 너비가 6~15 아미노산일 때 대개 무엇인가?

🤔 확인 문제

너비 범위를 6~50 으로 넓게 여는 것의 대가는?