11. 두 숫자가 같은 곳을 가리킨다 — 점수와 퍼센타일 · Dr. Son's mRNA Vaccine Design, First Steps II

예측 결과에 숫자가 두 개 붙어 나옵니다. 둘 다 "얼마나 잘 붙나" 를 말하는데 방향이 반대라 자주 헷갈립니다.

숫자	무엇	어느 쪽이 좋은가
EL 점수	예측한 결합의 세기	1 에 가까울수록 강하다
EL 퍼센타일 순위	다른 조각들과 견준 등수	낮을수록 강하다

논문이 붙인 기준은 이렇습니다 — 퍼센타일 1% 미만이면 강한 결합자, 1~2% 사이면 중간.

왜 두 개나 주는가

점수 하나로는 견줄 수가 없기 때문입니다.

대립유전자마다 점수의 눈금이 다릅니다. 어떤 HLA 는 대체로 높은 점수를 주고 어떤 HLA 는 짜게 줘요. 그래서 점수 0.8 이 어떤 대립유전자에서는 흔하고 어떤 데서는 아주 드뭅니다.

퍼센타일은 그 대립유전자 안에서의 등수라 눈금 차이를 지웁니다.

점수와 순위를 따로 움직여 보세요. 두 기준이 어긋나는 자리가 보입니다.

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같은 0.60 이 한쪽에서는 평범하고 한쪽에서는 최상위입니다. 눈금이 다르기 때문입니다.

Python Runs in your browser

# 눈금이 다른 두 시험을 원점수로 견주면 안 된다
import numpy as np

rng = np.random.default_rng(5)

# 대립유전자 A 는 후하게, B 는 짜게 점수를 준다 (설명용 예시)
a = rng.normal(0.70, 0.10, 2000)
b = rng.normal(0.35, 0.10, 2000)

mine = 0.60      # 내 조각의 점수

pa = float((a > mine).mean() * 100)
pb = float((b > mine).mean() * 100)

print("같은 점수 0.60 인데")
print("  후한 대립유전자 A 에서는 상위", round(pa, 1), "% → 평범합니다")
print("  짠   대립유전자 B 에서는 상위", round(pb, 1), "% → 아주 뛰어납니다")
print()
print("원점수는 못 견줍니다. 그래서 퍼센타일이 필요합니다.")

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EL 퍼센타일 순위가 낮을수록 좋은 까닭은?

🤔 Check yourself

점수 말고 퍼센타일이 따로 필요한 까닭은?