Lesson 15 of 20
네 자리 숫자를 처음 만난다 — 29,620 · 5,671 · 1,266 · 10
Step 2 결과 · 예측된 에피토프 전체
Step 2 의 수확입니다. 논문이 적은 그대로예요.
| 갈래 | 예측된 수 | 무엇으로 세었나 |
|---|---|---|
| MHC class I (CTL) | 29,620 | 9글자 조각 × 대립유전자 27개 |
| MHC class II (HTL) | 5,671 | 15글자 조각 × 대립유전자 27개 |
| 선형 B세포 | 1,266 | 문턱 위의 구간 |
| 입체 B세포 | 10 | 구조에서 묶인 덩어리 |
논문은 이것을 "빽빽한 지형(dense landscape)" 이라고 부릅니다. 좋은 표현이에요 — 지형이지 목적지가 아닙니다.
수확 전체 대비 최종 선택은 0.05% 남짓입니다. Step 2 는 버리는 걸음이 아니라 쌓는 걸음이에요.
Python
Runs in your browser
왜 class I 이 압도적으로 많은가
10강에서 미뤄 둔 물음입니다. 조각 수는 거의 같았는데 결과는 5배 넘게 차이 났어요.
까닭은 class I 예측이 더 확신 있게 자르기 때문입니다. 양끝이 막힌 홈은 규칙이 뚜렷해서 예측기가 후보를 많이 내놓습니다. 반면 class II 는 홈이 열려 있어 어디서 끊을지 자체가 모호해 같은 자리를 여러 번 세지 않게 됩니다.
즉 이 차이는 면역학적 사실이라기보다 예측 방법의 성질에 가깝습니다.
🤔 Check yourself
Step 2 가 내놓은 네 숫자를 가장 정확히 표현한 것은?
Answer 논문의 표현대로 지형입니다. 목적지가 아니에요. 한 개도 아직 고르지 않았습니다.
🤔 Check yourself
class I 이 class II 보다 훨씬 많이 나온 주된 까닭은?
Answer 조각 수는 거의 같았고 대립유전자도 27개로 같았습니다. 남은 차이는 세는 방식에서 왔습니다.