Lesson 14 of 20
FFPE — 조직을 굳혀 시간 속에 세워 둔다
SI 「Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) mouse tissue blocks」
여기서부터 이야기가 갈라집니다. 앞의 13강은 조직을 갈았습니다. 이제부터는 굳힙니다.
FFPE 는 네 글자가 각각 한 단계입니다.
| 글자 | 단계 | 무엇을 하나 |
|---|---|---|
| FF | Formalin-Fixed | 포르말린이 단백질끼리 다리를 놓아 그 자리에 고정한다 |
| P | Paraffin | 물을 빼고 파라핀을 스며들게 한다 |
| E | Embedded | 파라핀 블록으로 굳힌다 — 이제 얇게 자를 수 있다 |
고정이 하는 일이 핵심입니다. 포르말린(포름알데히드)은 단백질의 아미노기 사이에 메틸렌 다리를 놓습니다. 그 순간 조직 안의 모든 것이 있던 자리에 붙잡힙니다.
고정 = 시간을 멈추는 일
FFPE 의 값은 보관에 있습니다.
냉동 조직
RNA·단백질이 잘 남는다
영하 80도가 필요하다
형태가 덜 곱다
영하 80도가 필요하다
형태가 덜 곱다
FFPE 블록
형태가 아주 곱다
실온 서랍에서 수십 년
RNA 가 끊긴다
실온 서랍에서 수십 년
RNA 가 끊긴다
병원의 병리 서랍에 수십 년치 FFPE 블록이 쌓여 있는 이유가 이것입니다. 그리고 그 블록들이 지금 공간전사체의 재료가 되고 있어요.
🤔 Check yourself
포르말린 고정을 너무 오래 하면 생기는 문제는 무엇일까요?
Answer 고정은 단백질끼리 다리를 놓는 일입니다. 다리가 너무 많으면 항원이 파묻혀 면역염색이 안 되고, RNA 도 손상됩니다. 모자라도 지나쳐도 안 돼요.