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Lesson 14 of 20

FFPE — 조직을 굳혀 시간 속에 세워 둔다

SI 「Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) mouse tissue blocks」

FFPE — 조직을 굳혀 시간 속에 세워 둔다
포르말린은 단백질을 서로 묶어 그 자리에 붙잡습니다. 파라핀은 그 조직을 자를 수 있게 굳힙니다.

여기서부터 이야기가 갈라집니다. 앞의 13강은 조직을 갈았습니다. 이제부터는 굳힙니다.

FFPE 는 네 글자가 각각 한 단계입니다.

글자단계무엇을 하나
FFFormalin-Fixed포르말린이 단백질끼리 다리를 놓아 그 자리에 고정한다
PParaffin물을 빼고 파라핀을 스며들게 한다
EEmbedded파라핀 블록으로 굳힌다 — 이제 얇게 자를 수 있다

고정이 하는 일이 핵심입니다. 포르말린(포름알데히드)은 단백질의 아미노기 사이에 메틸렌 다리를 놓습니다. 그 순간 조직 안의 모든 것이 있던 자리에 붙잡힙니다.

고정 = 시간을 멈추는 일
고정 시간을 바꿔 보세요. 부족하면 어떻게 되고 지나치면 어떻게 되는지.
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FFPE 의 값은 보관에 있습니다.

냉동 조직
RNA·단백질이 잘 남는다
영하 80도가 필요하다
형태가 덜 곱다
FFPE 블록
형태가 아주 곱다
실온 서랍에서 수십 년
RNA 가 끊긴다

병원의 병리 서랍에 수십 년치 FFPE 블록이 쌓여 있는 이유가 이것입니다. 그리고 그 블록들이 지금 공간전사체의 재료가 되고 있어요.

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포르말린 고정을 너무 오래 하면 생기는 문제는 무엇일까요?