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Lesson 7 of 20

보정과 FMO — 새어 든 빛을 빼내기

겹침은 물리라 없앨 수 없다. 대신 계산으로 뺀다

보정과 FMO — 새어 든 빛을 빼내기
이웃 검출기로 새어 든 몫을 빼내는 일. 안 빼면 없는 양성이 생깁니다.

5강에서 봤듯이 형광의 방출 스펙트럼은 넓어서 이웃 검출기까지 걸칩니다. PE 를 붙인 세포가 APC 검출기에서도 조금 밝게 읽혀요.

보정(compensation)은 그 새어 든 몫을 계산으로 빼는 일입니다.

1. 형광 하나만 붙인 대조 시료를 검출기마다 만든다 (단일염색 대조)

2. PE 만 붙인 시료가 APC 검출기에서 얼마나 읽히는지 잰다 → 새는 비율

3. 진짜 시료에서 그 비율만큼 빼 준다

APC참 = APC읽힘 − (새는 비율 × PE읽힘)

보정을 안 하면 PE 가 밝은 세포가 전부 APC 양성처럼 보입니다. 있지도 않은 세포 집단이 생기는 것이죠.

보정을 켜고 꺼 보세요. 산점도에서 가짜 집단이 생겼다 사라집니다.
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보정이 끝나도 남는 물음이 있습니다. "이 세포가 진짜 양성인가, 아니면 그냥 배경인가?"

여기에 답하는 것이 FMO(Fluorescence Minus One) 대조입니다.

무염색 대조
아무것도 안 붙임
세포 자체의 자가형광만 본다
다른 형광이 새어 드는 몫은 못 본다
FMO 대조
보려는 것 하나만 빼고 다 붙임
그 검출기가 읽는 값 = 순전히 배경
여기가 곧 양성/음성의 경계

FMO 는 "다 넣었는데 이것만 뺐다" 는 시료입니다. 그 시료에서 읽히는 값이 곧 배경의 위쪽 끝이에요. 게이트를 거기에 긋습니다.

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FMO 대조 시료는 어떻게 만들까요?