Lesson 10 of 20
화산 그림 — 크기와 확실함을 한 장에
DepMap 24Q4 유전자 17,097개 전부
9강에서 두 가지 자를 따로 썼습니다. 둘을 한 장에 놓을 수 있습니다.
점 하나가 유전자 하나입니다. 1만 7천 개를 다 찍으면 가운데가 볼록한 산 모양이 되고, 양쪽 위로 뿔이 솟습니다. 그 생김새 때문에 화산 그림(volcano plot) 이라고 부릅니다.
p 가 작을수록 값이 커집니다. 위로 갈수록 확실하다는 뜻이 되도록 뒤집은 것입니다.
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WRN 은 왼쪽 끝에 홀로 떨어져 있습니다. 다른 어떤 점도 그만큼 왼쪽에 있지 않습니다.
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화산 그림의 쓸모는 두 자를 동시에 보게 만든다는 것입니다. 9강에서 우리는 t 로 세웠다 차이로 세웠다 하며 오갔습니다. 화산 그림에서는 그럴 필요가 없습니다 — 두 축이 이미 거기 있으니까요.
그리고 이 그림이 곧바로 다음 문제를 보여 줍니다. 세로로 높이 뜬 점이 너무 많습니다. 1만 7천 번 물었으니까요.
p<0.05 인 유전자가 2,649개입니다. 우연이라면 855개가 기대되고요. 이걸 다 믿을 수는 없습니다.
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왼쪽 위 구석은 아주 한산합니다. 표적 후보가 원래 그렇게 드뭅니다.
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🤔 Check yourself
화산 그림에서 표적 후보가 놓이는 자리는?
Answer 가로로 멀리(차이가 크고) 동시에 세로로 높이(확실한) 있는 자리입니다.
가운데 위는 확실하지만 차이가 작아 약이 되지 않고,
왼쪽 아래는 차이는 크지만 믿기 어렵습니다.
🤔 Check yourself
-log10(p) 를 세로축에 쓰는 이유는?
Answer p = 0.05 와 p = 1e-9 를 그대로 그리면 둘 다 0 에 붙어 구분되지 않습니다.
로그를 씌우면 1.3 과 9 로 벌어지고, 부호를 뒤집어 확실할수록 위가 되게 합니다.