유전자 하나를 끄면 세포가 죽는다 — 단, 그 암에서만

실험 하나를 상상해 봅시다. 접시 두 개에 사람 암세포를 각각 기릅니다. 왼쪽은 대장암 세포주 HCT-116, 오른쪽은 다른 대장암 세포주 SW620 입니다. 둘 다 대장암이고, 둘 다 사람에게서 온 것이고, 겉보기에는 비슷하게 자랍니다.

이제 두 접시 모두에서 WRN 이라는 유전자 하나를 끕니다. 완전히 같은 방법으로요.

왜 갈릴까요. 둘의 차이는 하나뿐입니다. HCT-116 은 현미부수체 불안정(MSI) 이라는 고장을 안고 있고, SW620 은 그렇지 않습니다.

여기까지는 이야기입니다. 이 강의가 하려는 것은 이야기를 듣는 게 아니라 그 이야기가 나온 표를 직접 보는 것입니다.

표는 이미 여러분의 브라우저 안에 있습니다. 세포주 608개, 유전자 17,097개. 칸마다 숫자가 하나씩 들어 있고, 그 숫자는 그 세포주에서 그 유전자를 껐을 때 얼마나 죽었는지입니다.

이제 WRN 한 줄만 꺼내 두 무리로 갈라 봅시다. 이 강의 전체가 사실 이 한 줄의 계산입니다.

위 위젯의 기본값인 −0.5 에서 세어 보면 이렇습니다.

약을 만드는 사람이 표적에게 바라는 것이 정확히 이 모양입니다. 걸리는 쪽은 확실히 죽고, 안 걸리는 쪽은 멀쩡할 것.

이 강의가 진짜로 다루는 것

WRN 이 답이라는 것은 이제 알려진 사실입니다. 이 강의의 목적은 그 답을 외우는 게 아닙니다.

2019년의 네 팀은 답을 몰랐습니다. 그들이 가진 것은 방금 여러분이 연 것과 같은 종류의 표 한 장뿐이었습니다. 유전자 1만 7천 개가 줄지어 있고, 그중 어느 것이 답인지는 적혀 있지 않은 표요.

그 표에서 이름 하나를 어떻게 끄집어내는가. 그것이 이 강의입니다.