3강 / 20강

복사기가 고장 난 세포 — 현미부수체 불안정

Cell Model Passports 세포주 608개 · MSI 43 · MSS 565

복사기가 고장 난 세포 — 현미부수체 불안정
같은 글자가 길게 반복되는 구간에서 복사기가 자꾸 미끄러집니다. 고쳐 주는 손이 없으면 미끄러진 채로 굳습니다.

세포가 분열할 때마다 DNA 30억 글자를 통째로 베낍니다. 베끼는 기계는 아주 정확하지만 완벽하지는 않습니다. 그래서 뒤에서 교정을 보는 조가 따라다닙니다. 이 조를 불일치 복구(MMR, mismatch repair) 라고 부릅니다.

일하는 단백질은 넷입니다 — MLH1 · MSH2 · MSH6 · PMS2. 넷 중 하나만 망가져도 교정조가 멈춥니다.

교정조가 멈추면 어디가 제일 먼저 티가 날까요. 같은 글자가 반복되는 구간입니다.

…ATGC TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA GGCT…

이렇게 짧은 토막(1~6글자)이 죽 반복되는 자리를 현미부수체(microsatellite) 라고 합니다. 사람 유전체에 수십만 군데 있습니다.

복사기는 이런 구간에서 자기가 몇 번째를 베끼고 있는지 놓치기 쉽습니다. 한 칸 미끄러지죠. 교정조가 있으면 바로 고쳐집니다. 없으면 미끄러진 길이 그대로 다음 세대로 넘어갑니다.

그렇게 반복 구간의 길이가 세포마다 제각각 달라진 상태 — 이것이 현미부수체 불안정 (microsatellite instability, MSI) 입니다. 반대로 멀쩡하면 MSS 라고 부릅니다.

MSI 는 아무 암에나 고르게 있지 않습니다. 특정 장기에 몰려 있습니다. 우리 표에서 MSI 세포주 43개가 어디서 왔는지 세어 봅시다.

대장 11개, 혈액 9개, 난소 6개, 자궁내막 6개… 고르지 않습니다. 이 쏠림이 13강에서 통째로 문제가 됩니다.
Python 브라우저에서 실행
복사기를 돌려 보세요. 교정조를 끄면 반복 구간의 길이가 어떻게 흩어지는지 보입니다.
불러오는 중…

MSI 인 암에는 특징이 몇 가지 따라옵니다.

🔢
변이가 아주 많다
교정을 못 하니 변이가 쌓입니다. /tmb 가 이 이야기입니다
🛡️
면역치료가 잘 듣는다
낯선 단백질이 많아 T세포가 알아봅니다
🧬
유전되기도 한다
린치증후군 — MMR 유전자를 물려받은 경우
📏
반복이 길어진다
이것이 16강에서 WRN 과 이어집니다
MMR 유전자들은 차이가 거의 없습니다 — 이미 망가진 유전자를 CRISPR 로 또 꺼도 새로 일어날 일이 없으니까요. 차이는 WRN 에서만 크게 납니다.
Python 브라우저에서 실행
🤔 확인 문제
현미부수체 불안정(MSI)이 생기는 직접적인 원인은?
🤔 확인 문제
MMR 유전자(MLH1 등)를 CRISPR 로 껐을 때 MSI 세포주에서 별다른 일이 일어나지 않은 이유는?