Lesson 9 of 20

선을 어디에 그을 것인가 — 문턱 10

폐선암 566명 · 문턱 5 에서 57.8%, 10 에서 34.6%, 20 에서 12.7%

TMB 는 0 부터 69.5 까지 이어진 연속량입니다. 그런데 치료 결정은 예 아니면 아니오입니다. 그래서 어딘가에 선을 긋습니다. 그 선이 10 mut/Mb 입니다.

왜 10 일까요. 인체 생물학에 10 이라는 자연 상수가 있어서가 아닙니다. KEYNOTE-158 이라는 임상시험에서 그 값으로 잘랐을 때 반응률 차이가 뚜렷했기 때문입니다. 곧 이 자료, 이 검사, 이 약에 대해 정해진 값입니다.

High school선을 어디에 그을 것인가

문턱을 바꾸면 고TMB 환자 비율 이 크게 달라진다.

문턱	고TMB 비율 (폐선암 566명)
5	57.8%
10	34.6%
20	12.7%

문턱 하나가 대상 환자를 4~5배 바꾼다

문턱 5 면 절반 이상이 대상이고, 문턱 20 이면 여덟 명 중 하나다.

문턱은 통계적 선택이 아니라 누가 치료를 받느냐의 선택이다

문턱을 5 에서 20 으로 옮기면 대상 환자가 327명에서 72명으로 줄어듭니다. 넷 중 하나만 남습니다.

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import tmb

t = tmb.luad()["tmb"]
print("문턱   TMB-High 인원   비율")
for cut in [5, 10, 15, 20, 25, 30]:
    n = int((t >= cut).sum())
    print(f"{cut:>4}   {n:>10}명   {100 * n / len(t):>5.1f}%")

High school문턱 10 은 어디서 왔나

근거	내용
KEYNOTE-158 시험	이 문턱으로 설계됨
FoundationOne 패널 기준	그 검사의 눈금
—	생물학적 근거는 약함

특정 검사의 값이라는 것

FDA 승인은 FoundationOne CDx 로 잰 TMB ≥ 10 이다. 그 검사로 잰 값 이라는 조건이 붙어 있다.

다른 검사로 잰 10 은 같은 뜻이 아닐 수 있다. 12강에서 그것을 확인한다.

문턱은 특정 측정 방법과 함께 정의된 것이지 보편적인 값이 아니다

위 곡선에는 계단도, 꺾인 자리도 없습니다. 매끄럽게 줄어들 뿐입니다. 자료 어디에도 '여기서 자르시오' 라는 표시가 없다는 뜻입니다.

📏

자료가 정하는 문턱

두 무리가 실제로 갈라져 있으면 골짜기가 보인다. TMB 에는 없다

🧑‍⚖️

사람이 정하는 문턱

시험에서 잘 갈라지는 값을 골라 정한다. 그 시험 바깥에서는 보장이 없다

🔁

그래서 필요한 것

문턱을 옮겨 가며 결론이 버티는지 보는 것 — 18강에서 한다

High school하나의 문턱이 모든 암종에

FDA 승인은 조직 불문 이다. 어느 암이든 TMB ≥ 10 이면 된다.

그런데 암종마다 분포가 다르다

암종	중앙 TMB	문턱 10 을 넘는 비율
흑색종	14.9	절반 이상
갈색세포종	0.30	거의 없음

같은 문턱이 암종마다 완전히 다른 의미 를 갖는다.

13강에서 33개 암종을 늘어놓고 본다

그러면 절대 문턱이 말이 되는지 를 눈으로 확인할 수 있다.

분포가 다른 집단에 같은 문턱을 쓰면 그 문턱의 뜻이 집단마다 달라진다

마흔 명이 문턱 ±1 안에 있습니다. 이 사람들의 판정은 규칙 하나에 흔들립니다.

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import tmb

t = tmb.luad()["tmb"]

# 문턱 10 에서 ±1 안에 있는 사람 — 규칙을 조금만 바꿔도 판정이 뒤집히는 사람들
near = t[(t >= 9) & (t <= 11)]
print("TMB 9 ~ 11 사이", len(near), "명 =", round(100 * len(near) / len(t), 1), "%")
print()
print("이 사람들은 5강의 침묵변이 한 줄, 6강의 VAF 필터 하나로 판정이 뒤집힙니다.")
print("문턱 근처 인원:", sorted(round(x, 2) for x in near)[:12], "…")

문턱 10 은 어디에나 같은 뜻일까

같은 문턱을 다른 암에 대면 뜻이 완전히 달라집니다. 흑색종은 64.8% 가 넘고, 갑상선암은 0.4% 가 넘습니다. 같은 선인데 어떤 암에서는 다수를, 어떤 암에서는 예외를 가리킵니다. 13강에서 33개 암종을 늘어놓고 이 문제를 정면으로 봅니다.

High school대안 — 상대 문턱

방식	내용	문제
절대 문턱 (10)	모든 암종에 같은 값	암종별 의미가 다름
전체 상위 %	코호트 안 순위	코호트 구성에 의존
암종 안 상위 %	같은 암 안에서 비교	암종별 분포가 필요

18강에서 셋 다 해 본다

같은 자료로 세 방식을 적용하고 결론이 같은지 본다.

어느 것이 맞나

생물학적으로는 세 번째 가 말이 된다 — "이 암종에서 상대적으로 높은가."

그런데 실무에서는 첫 번째 가 쉽다 — 암종별 기준선을 몰라도 되니까.

옳은 것과 쓰기 쉬운 것이 다를 때 대개 쓰기 쉬운 것이 채택된다

🤔 Check yourself

문턱 10 이라는 값의 근거로 옳은 것은?

🤔 Check yourself

문턱을 10 에서 20 으로 올리면 생기는 일로 옳은 것은?