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Dr. Seonggu Sohn's Probability and Statistics, First Steps

Could a difference this big
be nothing but chance?

Statistics answers one question. These twenty lessons take that sentence apart — what chance is, how you measure this big, which ruler to use, and how the answer fools you.
The examples are not invented. They are this site's own computed results — the mutation burden of 566 TCGA-LUAD patients, 347 miRNA tests, and twelve tumour types across 5,202 slides. Python runs right inside this page.

🐍 Python🎲 probability📏 intervals 🌫️ null distributions🔀 permutation · bootstrap🧮 multiplicity · FDR🇬🇧 English

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How you'll learn

🧱One place instead of fifteen

Null distributions were re-explained from scratch in /viper and /diggit, multiplicity in /mirna and /til. This course lays that foundation once.

🔢No invented examples

Not dice and factory defects but this site's own computed results — median 6.68 against mean 10.02, 103 out of 347, three out of twelve.

🔀Built by hand

Instead of memorising formulas you shuffle a null distribution into existence and bootstrap a confidence interval yourself. Then the formula stops being a black box.

🕳️How you get fooled

The last five lessons are the cases where the arithmetic is right and the sentence is wrong — the winner's curse, Simpson's paradox, and the trap inside the word 'adjusted'.

Full curriculum

흩어져 있던 것을 한곳으로 — 이 20강이 메우는 칸

이 사이트의 열다섯 과목이 저마다 다시 설명하고 있던 것

우연 — 한 번은 알 수 없고 여러 번은 알 수 있다

확률은 한 번의 일이 아니라 <b>되풀이의 성질</b>에 붙는 이름

분포 — 평균 하나로 뭉개면 잃는 것

TCGA-LUAD 566명의 변이부담 · 중앙값 6.68 대 평균 10.02

표본 — 일부만 보고 전체를 말한다

표본분포 · 그리고 '많이 뽑는 것' 보다 중요한 것

중심극한정리 — 왜 평균은 늘 종 모양이 되나

재료가 무엇이든 평균을 내면 같은 모양으로 모인다

표준오차 — 흩어짐과 불확실은 다른 것이다

σ 는 사람마다 다른 정도, SE 는 내 추정이 흔들리는 정도

신뢰구간 — 95%가 뜻하지 않는 것

구간이 흔들리는 것이지 참값이 흔들리는 것이 아니다

귀무분포 — 아무 일도 없었다면 어땠을까

/viper 와 /diggit 이 실제로 만들어 쓰는 그것

p 값 — 무엇을 말하고 무엇을 말하지 않나

/mirna 가 돌린 347개의 검정으로

검정력 — 있는 것을 못 찾는 쪽의 잘못

1종 오류만 지키다 2종 오류를 놓치는 일

어떤 검정을 쓸 것인가 — 자료가 정한다

묻는 것 · 재는 방식 · 짝이 있나, 이 셋이면 거의 정해진다

순열검정 — p 값을 손으로 만든다

/til 18강이 하는 그 일 · 공식 없이 검정하기

붓스트랩 — 신뢰구간을 손으로 만든다

가진 자료를 모집단인 셈 치고 다시 뽑는다

다중검정 — 347번 던지면 무엇이 걸리나

/mirna 의 실제 결과 · p<0.05 가 103개, 우연으로 기대되는 것 17.35개

FDR — 몇 개가 틀려도 괜찮다고 정하는 것

/mirna 의 347개 · q<0.05 로 22개, q<0.10 으로 49개

생존분석 — 아직 일어나지 않은 일을 세는 법

중도절단 · 카플란-마이어 · 로그순위검정

회귀 — '조정했다' 는 말의 뜻

기울기 하나가 대답하는 물음은 생각보다 좁다

교란 — 나눠 보면 오르고 합치면 내려간다

심슨의 역설 · 그리고 어느 쪽이 맞는 답인가

실습 종합 — /til 의 12개 암종을 다시 검정한다

이 사이트의 실제 결과에 14강과 15강을 적용해 본다

정리 — 통계가 말할 수 있는 것과 없는 것

그리고 이 20강이 어느 강의로 이어지는가