Lesson 8 of 20
유전자 이름이 바뀐다 — 별칭과 엑셀 참사
MARCH1 이 날짜가 되고, 같은 유전자가 이름 셋을 갖는다
유전자 기호는 HGNC 가 관리합니다. 그런데 관리한다는 말은 가끔 바꾼다는 뜻이기도 합니다.
이 MAF 는 19개짜리라 무사합니다. 유전자 2만 개짜리 표를 스프레드시트로 한 번만 열어도 오염됩니다.
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규칙 — 이름은 표시용, 조인은 좌표로
이름으로 조인하면
별칭이 다르면 안 붙습니다
별칭이 겹치면 엉뚱한 데 붙습니다
엑셀을 거쳤으면 이름이 아예 사라집니다
별칭이 겹치면 엉뚱한 데 붙습니다
엑셀을 거쳤으면 이름이 아예 사라집니다
좌표로 조인하면
이름이 뭐가 됐든 자리는 그대로입니다
빌드만 맞추면 됩니다(7강)
이름은 나중에 붙여 넣기만 하면 됩니다
빌드만 맞추면 됩니다(7강)
이름은 나중에 붙여 넣기만 하면 됩니다
부득이하게 이름으로 조인해야 한다면 HGNC 의 별칭표를 먼저 통과시키세요. 그리고 매칭 안 된 개수를 반드시 세세요.
🤔 Check yourself
유전자 이름 대신 좌표로 조인하는 것이 안전한 이유는?
Answer HGNC 가 기호를 바꾸고, 별칭이 겹치고, 스프레드시트가 먹어 버립니다. 유전체 위 자리는 그런 일을 겪지 않습니다 — 빌드만 맞추면 됩니다.
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2020년에 MARCH1 이 MARCHF1 으로 바뀐 이유는?
Answer 소프트웨어를 고칠 수 없으니 생물학의 이름을 고쳤습니다. 그 결과 지금은 옛 이름과 새 이름이 둘 다 돌아다녀 별칭 문제가 오히려 늘었습니다.