Lesson 1 of 20

방법 문단은 화학 처방전이다

SI 「Western blot analysis」한 줄을 통째로 해부한다

논문 부록에서 가장 짧은 문단 하나를 가져옵니다.

For cell lysis, we used a lysis buffer containing 20 mM HEPES (pH 7.2),
150 mM NaCl, 0.5% Triton X-100, 10% glycerol, and 0.1% SDS.
This buffer was supplemented with 0.1% of phosphatase inhibitor cocktail.

두 문장입니다. 그런데 여섯 가지 결정이 들어 있어요. 다르게 정했으면 결과가 달라졌을 결정들입니다.

High school방법 문단은 화학 처방전이다

논문의 방법(Methods) 부분은 읽기 지루합니다. 숫자와 시약 이름이 빽빽하죠. 그런데 그 한 줄 한 줄이 요리 레시피와 같습니다.

요리 레시피	실험 방법
재료와 양	시약과 농도
온도와 시간	온도와 시간
순서	순서
"왜 그렇게 하나"는 안 적힘	같음

이 강의는 그 "왜"를 채워 넣는 이야기입니다.

High school왜 이유가 안 적혀 있나

이유	내용
지면 제한	논문은 짧아야 함
업계 상식	같은 분야 사람은 다 안다고 전제
관행	"원래 이렇게 한다"
실제로 모름	선배에게 배운 대로 함

마지막 줄이 은근히 흔합니다. 그래서 실험이 안 될 때 어디를 고쳐야 할지 모르게 돼요.

이유를 알면 고칠 수 있고, 바꿀 수 있고, 판단할 수 있습니다.

성분	무슨 일	빼면	강
20 mM HEPES pH 7.2	pH 를 붙잡는다	단백질이 변성될 수 있다	3강
150 mM NaCl	이온세기를 준다	비특이 결합이 남는다	4강
0.5% Triton X-100	막을 녹인다	세포가 안 깨진다	6강
10% 글리세롤	단백질을 안정시킨다	보관 중 활성이 준다	7강
0.1% SDS	남은 결합을 푼다	덜 풀린 덩어리가 남는다	6·8강
탈인산화효소 억제제	인산기를 지키다	p-STAT3 띠가 사라진다	—

High school한 줄을 해부한다는 것

예를 들어 "PBS containing 1% FBS"라는 한 줄이 있다고 합시다. 여기서 물을 수 있는 것들이에요.

물음	어느 강
PBS가 뭐고 왜 쓰나	4강
1%는 무엇에 대한 1%인가	2강
FBS는 왜 넣나	4강
왜 하필 이 조합인가	4강

한 줄에 네 개의 결정이 들어 있습니다 — 각각 이유가 있습니다.

이 20강의 뼈대

⚖️

2~5강 · 재는 법

몰농도 · 완충액 · PBS · 배양액의 숨은 완충계

🫧

6~9강 · 푸는 법

계면활성제 · 용해 완충액 · SDS-PAGE · 화학발광

🧬

10~14강 · 넣고 재는 법

지질 트랜스펙션 · 선택 항생제 · 핵산 추출 · 흡광 · SYBR

🔬

15~19강 · 보는 법

고정 · H&E · 형광체 · DAPI · Xenium

High school이 강의가 20강 동안 하는 일

강	다루는 것
2–5	기본 — 농도 · 완충액 · PBS · 배양 조건
6–9	단백질 — 계면활성제 · 용해 · 전기영동 · 검출
10–11	세포에 유전자 넣고 고르기
12–14	핵산 — 추출 · 정량 · qPCR
15–18	조직과 염색 — 고정 · H&E · 형광 · DAPI
19–20	공간 전사체 실습 · 안전과 기록

목표는 실험을 하는 것이 아니라 방법 문단을 읽고 쓸 수 있게 되는 것입니다.

🤔 Check yourself

논문의 용해 완충액에 탈인산화효소 억제제를 넣은 이유는?