조박사의 실험실 화학 첫걸음

방법 문단은
화학 처방전이다

20 mM HEPES (pH 7.2), 150 mM NaCl, 0.5% Triton X-100, 10% glycerol, 0.1% SDS — 두 문장에 여섯 가지 결정이 들어 있습니다.
이 20강은 그 결정들을 읽는 법입니다. 시리즈의 첫째 과목 /chem 이 분자 자체를 다뤘다면, 여기서는 그 분자를 다루는 시약을 다룹니다.

⚖️ 몰농도·완충액🫧 계면활성제🔬 고정·H&E 🌈 형광 보정🇰🇷 한국어

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이렇게 배웁니다

📄방법 문단 한 줄에서 시작

모든 강이 논문 부록의 시약 한 줄을 펼친 것입니다. 어느 문단인지 강마다 부제에 적어 두었습니다.

🎛️농도와 시간을 흔들어 보기

CMC 아래로 내려 보고, 산알코올에 오래 담가 보고, 노출을 늘려 봅니다. 무엇이 무너지는지 보입니다.

⚖️논문 값과 교과서 값을 가른다

0.5% Triton 은 논문 값이고 CMC 0.0155% 는 교과서 값입니다. 화면에서 언제나 갈라 표시합니다.

🧬마지막에 Xenium 을 해부한다

19강에서 논문의 Xenium 문단 열두 줄을 일곱 단계로 갈라, 각 단계가 어느 강의 화학인지 짚습니다.

전체 커리큘럼

방법 문단은 화학 처방전이다

SI 「Western blot analysis」한 줄을 통째로 해부한다

농도를 재는 세 가지 말 — mM · % · µg/ml

논문은 세 가지를 한 문단에 섞어 쓴다

완충액 고르기 — 온도가 pH 를 움직인다

HEPES · Tris · 인산, 그리고 4°C 의 함정

PBS — 세포를 다치지 않게 씻는 물

SI 「PBS solution containing 1% FBS」

배양기가 5% CO₂ 인 이유

SI 「DMEM · 10% FBS · 5% CO₂ · 37°C」

계면활성제 — 0.5% Triton 과 0.1% SDS 를 함께 쓴 이유

CMC · 미셀 · 비이온성과 음이온성

용해 완충액 한 줄을 짓는다

다섯 성분이 하는 일과, 하나를 빼면 무엇이 무너지나

SDS-PAGE — 전하를 균일하게 만들어 크기로만 가른다

웨스턴블롯이 서 있는 전제

띠가 빛나는 화학 — HRP 와 루미놀

SI Table S4 의 항체들이 실제로 어떻게 보이나

지질 트랜스펙션 — 양이온이 음이온을 싣는다

SI 「Lipofectamine RNAiMAX」·「8 µg/ml Polybrene」

퓨로마이신 3 µg/ml — 살아남은 것만 고른다

SI 「selected with 3 µg/ml puromycin」

핵산 추출 — 카오트로프와 실리카

SI 「RNA was extracted using the RNA-spin kit」

NanoDrop — 빛이 얼마나 줄었나로 양을 잰다

SI 「quantity was assessed using a NanoDrop」

SYBR Green — 이중가닥에 끼어들면 밝아진다

SI 「QuantStudio5 · 2X Taq premix · SYBR Green」

포르말린 고정 — 메틸렌 다리로 시간을 멈춘다

SI 「Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE)」

H&E — 산·염기 염색의 교과서

SI 「Harris's hematoxylin 5분 · 산알코올 10초 · 에오신 2분」

형광체 — 왜 색이 새고 왜 보정이 필요한가

SI Table S6 「FITC · PE-Cy7 · APC-Cy7」

DAPI — DNA 의 홈에 끼어 앉는다

SI 「Quality assessment involved DAPI staining」

【실습】 Xenium 슬라이드의 화학

SI 「Xenium Prime 5K Mouse Pan Tissue and Pathways Assay」

정리 — 시약 안전과 기록

그리고 방법 문단을 스스로 쓰는 법