농축 — 부하들이 위쪽에 몰려 있나

유전자 20,000개를 시그니처 순으로 줄 세웠습니다. 맨 앞은 가장 많이 올라간 유전자, 맨 뒤는 가장 많이 내려간 유전자입니다.

이제 이 줄 위에 MYC 의 부하 50명을 형광펜으로 칠해 봅니다. 그 50개가 줄 전체에 고루 흩어져 있다면? 아무 일도 없는 것입니다. 그런데 50개 중 40개가 맨 앞쪽 500등 안에 몰려 있다면? 우연이라고 하기 어렵습니다. MYC 가 뭔가 하고 있는 거예요.

이 "몰림"을 숫자로 재는 것이 농축(enrichment) 입니다. 유전자 세트 분석에서 가장 널리 쓰이는 방법이 GSEA 이고, VIPER 의 aREA 는 그 아이디어를 이어받아 더 빠르고 정교하게 만든 것입니다.

누적 걸음 — GSEA 의 핵심 그림

줄의 앞에서 뒤로 한 칸씩 걸어가면서 이렇게 합니다.

• 지금 밟은 유전자가 우리 부하면 → 위로 한 걸음 (부하 수가 적을수록 큰 걸음)
• 우리 부하가 아니면 → 아래로 아주 조금 (전체가 많으므로 작은 걸음)

부하들이 앞쪽에 몰려 있으면 초반에 계속 위로 올라가다가 산 하나가 생깁니다. 그 산봉우리의 높이가 농축 점수(Enrichment Score, ES)입니다. 부하가 고루 흩어져 있으면 오르내리다 0 근처를 맴돌 뿐 산이 안 생깁니다.

🎮 부하를 줄 위에서 옮겨 보세요

아래 줄에서 부하(색칠된 칸)를 클릭해 자리를 옮길 수 있습니다. 앞쪽으로 모으면 산이 높아지고, 흩뿌리면 산이 사라집니다. 뒤쪽으로 모으면 어떻게 되는지도 꼭 해 보세요 — 산이 아래로 파입니다. 그것은 "부하들이 전부 내려갔다"는 뜻이고, MoR 이 양수라면 상사가 잠잠하다는 증거가 됩니다.