자기를 닮으면 안 된다 — 사람 단백질체와 장내세균 79종

백신은 면역에게 '이것을 적으로 여겨라' 고 가르칩니다. 그런데 그 조각이 내 몸의 단백질과 닮았다면 어떻게 될까요.

두 가지 가운데 하나가 일어납니다.

둘 다 나쁩니다. 그래서 논문은 조각을 고른 뒤 내 것과 닮았는지를 확인합니다.

무엇과 견주나

두 번째가 눈에 띕니다. 장내세균은 남인데 왜 볼까요.

장에는 세균이 늘 살고 있고, 몸은 그것들과 싸우지 않기로 이미 합의해 두었습니다. 백신 조각이 장내세균 단백질과 닮았다면 몸은 '아, 늘 있던 것' 하고 넘어갈 수 있습니다.

Diamond 와 BLASTp

사람 단백질체는 2만 개가 넘고, 세균 79종을 더하면 수십만 개입니다. 스무 개 조각을 그 전부와 견주려면 빨라야 합니다.

논문은 Diamond 로 지역 데이터베이스를 만들고 BLASTp 로 견줍니다. Diamond 는 BLAST 와 같은 일을 훨씬 빨리 하는 도구입니다.

통과 기준은 두 줄입니다.

둘 다 '닮지 않았다' 를 뜻하는 방향입니다. E-value 는 클수록 우연, bit score 는 작을수록 약한 일치니까요.

분자 흉내라는 현상

병원체 조각이 사람 단백질과 닮아 자가면역이 생기는 일을 분자 흉내 라고 부릅니다. 드물지만 실제로 보고된 일입니다.

두 경우 모두 감염에서 일어난 일입니다. 백신은 조각을 미리 고를 수 있으니 이런 위험을 설계 단계에서 뺄 수 있습니다. 그것이 이 단계의 목적입니다.

다만 16강에서 보듯, 이 논문의 거르는 기준으로는 그 일이 실제로 일어나지 않습니다.