6. 에피토프란 무엇인가 — 프로테아좀과 제시 · 정교수의 mRNA백신 디자인 첫걸음 I

면역세포는 단백질을 통째로 알아보지 않습니다. 몸은 단백질을 잘게 잘라 짧은 조각으로 만든 뒤, 그 조각을 세포 표면에 들고 나와 보여 줍니다.

이 보여 주는 조각을 에피토프(epitope) 라고 합니다.

에피토프 = 면역이 실제로 보는 것

그러니까 백신이 할 일은 '단백질을 넣는 것' 이 아니라 올바른 조각이 만들어지게 하는 것입니다.

세 갈래의 조각

🗡️

CTL 에피토프

9잔기 · MHC I 에 실린다 · 감염된 세포를 죽이는 T세포를 부른다

📣

HTL 에피토프

15잔기 · MHC II 에 실린다 · 다른 면역세포를 지휘하는 T세포를 부른다

🎯

B세포 에피토프

16잔기 · 자르지 않은 단백질 표면을 항체가 직접 붙잡는다

논문이 고른 개수는 각각 8 · 7 · 5, 합쳐서 스무 개입니다.

단백질을 잘라 세 갈래 조각을 만들어 보세요. 길이와 실리는 곳이 다릅니다.

불러오는 중…

MHC 가 사람마다 다르다는 문제

조각을 실어 나르는 MHC(사람에서는 HLA 라고 부릅니다)는 사람마다 다릅니다. 그것도 아주 많이 다릅니다.

그래서 어떤 조각은 나에게는 실리고 당신에게는 안 실립니다. 백신 하나가 모두에게 똑같이 듣지 않는 까닭이 여기 있습니다.

논문이 뒤에서 계산하는 적용범위(population coverage) 가 바로 이 문제를 숫자로 만든 것입니다. III 권에서 다룹니다.

257잔기. 이 숫자를 기억해 두십시오 — 18강에서 다시 씁니다.

Python 브라우저에서 실행

# 논문이 고른 에피토프 스무 개의 구성을 세어 본다.
groups = [("CTL", 8, 9), ("HTL", 7, 15), ("LBL", 5, 16)]
total_n = 0
total_aa = 0
for name, n, ln in groups:
    aa = n * ln
    total_n += n
    total_aa += aa
    print("%-4s %d 개 x %2d 잔기 = %3d 잔기" % (name, n, ln, aa))
print("-" * 34)
print("합계 %d 개 %14d 잔기" % (total_n, total_aa))
print()
print("이 257 잔기가 백신 구조물의 '알맹이' 다.")
print("여기에 링커와 보조제가 붙어 419 잔기가 된다 (II 권 주제).")

MHC I 과 MHC II 가 보여 주는 대상이 다르다

	MHC I	MHC II
어느 세포에	거의 모든 세포	면역을 전문으로 하는 세포만
무엇을 싣나	세포 안에서 만들어진 것	세포가 밖에서 삼킨 것
누구에게 보이나	세포독성 T세포 — 죽인다	도움 T세포 — 지휘한다
뜻하는 신호	"내 안에 이런 게 있다"	"밖에서 이런 걸 주웠다"

mRNA 백신이 특별한 까닭이 여기 있습니다. mRNA 는 세포 안에서 단백질을 만들게 합니다. 그러면 MHC I 길이 자연스럽게 열립니다 — 단백질을 그대로 주사하는 백신은 그 길로 잘 못 갑니다.

🤔 확인 문제

CTL 에피토프가 9잔기인 까닭은?

🤔 확인 문제

백신 하나가 사람마다 다르게 듣는 가장 큰 까닭은?