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Prof. Jeong's mRNA Vaccine Design, First Steps I

Designing a vaccine
for a disease nobody has had

BtHKU5-CoV-2, reported from bats in March 2025, uses human ACE2 — the same receptor SARS-CoV-2 used. Not one human case has been reported.
This paper designed a vaccine candidate for it without a single experiment and submitted five months later. This volume follows the first half of that pipeline: choosing a target and screening down to twenty epitopes.
We do not only follow. We recount the paper's own tables and find several facts the paper's text does not state.
Python runs right inside this page. There is nothing to install.

🐍 Python🦇 BtHKU5-CoV-2🧬 epitopes 📐 cross-checks🪤 pitfalls🧾 prediction vs evidence🇬🇧 English

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How you'll learn

🦇Start with why it was urgent

A bat virus that uses human ACE2. Human cases so far: zero.

⛏️Run the funnel yourself

Seven tools, six thresholds. Move a threshold and the vaccine changes.

📐Recount the tables

That twenty epitopes sit in eleven loci is not in the paper. We count it.

🧾Write down what was not done

Every number here is a prediction. Lesson 20 draws the line.

Full curriculum

박쥐에서 나온 바이러스 하나 — 왜 이 논문이 급했나

서론 · 2025년 3월 보고에서 2026년 4월 게재까지

ACE2 를 쓴다는 말의 무게 — 숙주 범위와 넘어옴

서론 · 논의 첫 문단

표적을 스파이크로 정한다 — 하나를 고르면 나머지를 버린다

방법 1 · 논의 둘째 문단

여섯 균주 중 441 을 고른 까닭 — 91.2~99.2% 와 '대표'

방법 1 · 방법 3

접근번호는 주소다 — GenBase 와 유전체 여섯

방법 1 · 방법 3 · 자료 공개 문단

에피토프란 무엇인가 — 프로테아좀과 제시

저자 요약 · 방법 2

CTL 에피토프 — NetCTL 1.2 와 문턱 0.75

방법 2.1 · Table 1

문턱을 고르는 일 — VaxiJen 0.4 가 하는 일과 못 하는 일

방법 2.1~2.3 · S1 Table

독성과 알레르기를 거른다 — AllerTOP 과 ToxinPred

면역원성과 결합력 — 깔때기를 세어 본다

방법 2.1 · Table 1 · S1 Table

HTL 에피토프 — IC50 과 %Rank 는 다른 자다

방법 2.2 · Table 2

일곱 가운데 셋은 논문 자신의 기준으로 약한 결합이다

방법 2.2 와 Table 2 를 나란히 놓고

B세포 에피토프 — 16잔기와 RBD 라는 두 번째 조건

방법 2.3 · 결과 1 · Table 3

보존성 6/6 — 여섯 균주를 tblastn 으로 견주다

방법 3 · 결과 1 · Table 1~3 의 마지막 칸

자기를 닮으면 안 된다 — 사람 단백질체와 장내세균 79종

방법 3 둘째 문단

짧은 조각에서는 E-value 가 아무도 거르지 못한다

방법 3 의 두 줄을 Table 1~3 의 서열에 대어 보면

스무 개를 스파이크 지도에 얹으면 열한 자리뿐이다

Table 1·2·3 의 시작 위치를 전부 모아서

적재량 257잔기 가운데 79잔기가 중복이다

17강의 열한 자리를 잔기 수로 환산하면

종합 실습 — 깔때기를 처음부터 다시 돌린다

Table 1·2·3 을 재료로

말할 수 있는 것과 말할 수 없는 것

한계 절 · 그리고 우리가 더한 것