두 번째 층 — 유전자를 끄는 22 글자

RNA 시퀀싱으로 유전자 발현을 잰다고 하면 보통 mRNA 를 셉니다. "이 유전자가 얼마나 켜져 있나" 를 재는 것이죠.

그런데 세포 안에는 mRNA 를 만드는 쪽 말고 끄는 쪽도 있습니다. 그중 하나가 microRNA, 줄여서 miRNA 입니다.

miRNA 가 표적을 붙잡으면 두 가지 중 하나가 일어납니다.

• 번역을 막는다 — mRNA 는 그대로 있는데 단백질이 안 만들어진다
• mRNA 를 분해한다 — mRNA 자체가 줄어든다

포유동물에서는 두 번째, 즉 mRNA 분해가 주된 방식이라는 것이 알려져 있습니다. 이 사실이 이 강의 전체를 가능하게 합니다. mRNA 를 세는 것만으로도 miRNA 가 일한 흔적을 볼 수 있다는 뜻이니까요.

왜 표 두 장이 필요한가

miRNA 는 너무 짧아서 보통의 RNA-seq 으로는 잡히지 않습니다. 라이브러리를 만들 때 짧은 조각을 걸러 버리기 때문입니다. 그래서 miRNA 를 재려면 small RNA-seq 이라는 별도의 실험을 해야 합니다.

같은 세포, 같은 처리, 그런데 다른 실험 · 다른 표본 수 · 다른 기계. 이 둘을 겹쳐 읽으려면 먼저 같은 자로 맞추는 일부터 해야 합니다. 그것이 2~4강입니다.

🎮 두 층 실험실

miRNA 층을 켜고 끄면서, mRNA 만 보고 있을 때 무엇을 놓치는지 보세요.