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Dr. Yoo's In Vivo Experiments, First Steps

Confirming a computed gene
in a living body

If the 20 lessons at /gene were about finding DDX54 with ARACNE-VIPER-DIGGIT, these 20 are about confirming that prediction in mice.
Step by step, with runnable cells and widgets, you retrace the hands behind every bar and curve in Fig. 4.

🐁 Syngeneic💉 anti-PD1📐 Tumor volume 📉 Kaplan-Meier🇬🇧 English

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How you'll learn

📄Start from one line of the paper

Every lesson unfolds one line from the paper's methods. The subtitle of each lesson says exactly which line.

▶️Run the numbers yourself

Tumor volume, Kaplan-Meier, log-rank, statistical power — all worked out by hand, right in the browser.

🎛️Decide it differently

Remove a group, change the cell count, move the cut-point. You see exactly where the conclusion wobbles.

⚖️Only what can be claimed

The final lesson separates what this experiment can claim from what it cannot.

Full curriculum

접시로는 안 되는 것 — 면역세포가 없는 실험의 한계

논문 Fig. 4 도입 · 우리가 20강 동안 확인할 것

동계이식 — 면역이 살아 있는 유일한 이식

SI 「Construction of LLC1 and KLN205 syngeneic mouse models」

네 가지 암 모델 — 무엇을 볼 수 있고 무엇을 못 보나

동계이식 · 이종이식 · 유전자변형 · PDX

IACUC — 실험 전에 먼저 통과해야 하는 문

SI 「All animal procedures were IACUC approved (KA2019-24)」

보이지 않는 감염 — 사육환경이 결과를 바꾼다

SI Fig. S7D · 「periodically confirmed to be free of murine viral pathogens」

주사 일주일 전 — 8주령 암컷과 제모

SI 「Female C57BL/6N mice (8-week-old) ... the mice were shaved」

피하주사 — 10만 개와 50만 개는 왜 다른가

SI 「1x10^5 cells (LLC1) or 5x10^5 cells (KLN205) ... injected subcutaneously」

200 µg 을 이틀마다 — 투여 일정이 곧 실험이다

SI 「200µg anti-mouse PD1 ... every two days」 · BioXCell BE0273

왜 두 군이 아니라 네 군인가 — 2×2 설계

논문 Fig. 4A 실험 설계 · WT/KD × 아이소타입/항-PD1

무작위배정 — 나누는 사람의 손을 묶는다

실험 설계와 재현성 · 왜 눈대중으로 나누면 안 되나

캘리퍼 두 값에서 부피로 — L × W² / 2 는 어디서 왔나

논문 Fig. S12B 종양 성장곡선 · 종양부피 공식

성장곡선 — 네 줄이 갈라지는 그림 읽기

논문 Fig. 4C · Fig. S12B

적출 종양의 무게 — 부피와 어긋날 때

논문 Fig. 4B · Fig. S12C · 종말점 종양중량

성장비 — 출발선이 다를 때 무엇을 견주나

논문 Fig. S12B 「tumor growth ratios」

카플란-마이어 — 계단이 내려가지 않는 자리

논문 Fig. 4D · Fig. S12D · 「all ... showed complete survival」

로그순위검정 — 두 곡선이 다르다고 말할 수 있나

SI 「compared ... using the log-rank test」

네 군을 견줄 때 — ANOVA 와 본페로니

논문 Fig. 4 「ANOVA with the Bonferroni post hoc test」

n = 7 은 어디서 왔나 — 너무 적어도 안 되는 이유

논문 Fig. 4 「n = 7 (LLC1), n = 5 (KLN205)」 · 3R 의 Reduction

마우스에서 사람으로 — 환자 코호트로 확인하기

SI Figs. S6A·S6B · 「survival outcomes in anti-PD-1/PD-L1-treated lung cancer patients」

적출과 정리 — 이 종양이 다음 강의로 간다

SI 「After euthanizing the LLC1 syngeneic mouse model...」 · 말할 수 있는 것과 없는 것