Lesson 20 of 20
말할 수 있는 것과 말할 수 없는 것
이 강의가 실제로 얻은 결과와 그 결과의 한계
스무 강을 지나 우리가 실제로 얻은 것을 적어 봅니다.
말할 수 있는 것
✅ 이렇게 말해도 된다
"네 개의 독립된 공개 자료에서 CTHRC1 의 발현이
IPF 폐조직에서 일관되게 높았다 (합친 Hedges' g = +2.34, I² = 0%)."
"이 신호는 대조군의 출처가 서로 다른 네 시리즈에서 모두 같은 방향이었다."
"MMP7 은 네 시리즈 모두에서 상승했으나 시리즈 사이 이질성이 중간 정도였다 (I² = 50.3%)."
"이 신호는 대조군의 출처가 서로 다른 네 시리즈에서 모두 같은 방향이었다."
"MMP7 은 네 시리즈 모두에서 상승했으나 시리즈 사이 이질성이 중간 정도였다 (I² = 50.3%)."
말할 수 없는 것
❌ 이렇게 말하면 안 된다
"CTHRC1 이 IPF 를 일으킨다" — 발현 자료는 방향을 모릅니다.
"CTHRC1 을 막으면 IPF 가 낫는다" — 교란 실험을 하나도 안 했습니다.
"IPF 에서 1,470개 유전자가 변한다" — 세포 구성 변화와 구분하지 못했습니다.
"TNIK 은 IPF 와 관계없다" — 우리 방법이 못 본 것이지 없는 게 아닙니다.
"CTHRC1 을 막으면 IPF 가 낫는다" — 교란 실험을 하나도 안 했습니다.
"IPF 에서 1,470개 유전자가 변한다" — 세포 구성 변화와 구분하지 못했습니다.
"TNIK 은 IPF 와 관계없다" — 우리 방법이 못 본 것이지 없는 게 아닙니다.
여기서 나가는 길이 다섯 갈래입니다. 전부 이 사이트 안에 있어요.
| 메우려는 구멍 | 필요한 자료 | 강의 |
|---|---|---|
| 원인인가 결과인가 | 유전자를 끄고 무슨 일이 생기는지 본다 | /pseq Perturb-seq |
| 세포 구성인가 유전자인가 | 세포 하나씩 따로 잰다 | /immune 단일세포 면역지도 |
| 키나아제 같은 조용한 표적 | 경로 활성과 네트워크 위치 | /viper · /arac |
| 사람 유전학의 뒷받침 | 변이가 병 위험을 바꾸는가 | /gwas GWAS 카탈로그 |
| 원시 서열이 필요할 때 | 정렬 전의 read 를 직접 다룬다 | /sra SRA |
그리고 이 방법을 다른 병에 그대로 대 보는 강의가 있습니다 —
/als 는 중추신경계 자료와 iPSC 운동신경세포로 ALS 표적을 찾습니다.
1강에서 이야기한 그 논문이에요.
여덟 줄 중 셋만 바꾸면 다른 병에 그대로 씁니다.
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🤔 Check yourself
이 강의의 결과로 "CTHRC1 이 IPF 를 일으킨다" 고 말할 수 없는 이유는?
Answer CTHRC1 의 통계는 흠잡을 데 없습니다(g=+2.34, I²=0%). 그러나 관찰일 뿐이에요. 인과를 말하려면 껐다 켜 보는 실험이 필요합니다.
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이 강의가 TNIK 을 찾지 못한 것을 어떻게 해석해야 하나요?
Answer TNIK 억제제는 실제로 임상에 갔습니다. 못 찾은 것은 방법의 한계이지 TNIK 의 문제가 아니에요. 사각지대를 아는 것이 방법을 아는 것입니다.
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이 강의의 분석을 다른 병에 옮길 때 다시 정해야 하는 것은?
Answer 통계 절차는 병과 무관합니다. 그러나 '얼마나 커야 큰 것인가' 는 병마다 다르므로 자료를 보고 다시 정해야 해요.