19강 / 20강

처음부터 다시 — 두 층으로 표적 순위표를 만든다

1강부터 18강까지를 한 번에

이 강의에서 내린 결정들을 한자리에 모읍니다.

강	내린 결정	다르게 정하면
5	세 시리즈 이상에 있으면 합친다	다섯 전부를 요구하면 5,545개로 갇힌다
6	특성 줄을 통째로 이어 붙인다	줄 번호를 믿으면 GSE20589 에서 틀린다
7	사후지연은 보정에 안 쓰고 기록만	결측을 버리면 표본을 다시 고르는 셈이 된다
8	GSE18920 은 운동신경세포만	전각도 넣으면 같은 환자가 두 번 세어진다
9	시리즈 안에서 먼저 뺀다	이어 붙이면 조직 차이가 병 신호로 둔갑한다
10	무작위효과 · BH	고정효과면 I² 높은 유전자를 과신한다
13	하위군을 나누지 않았다	나누면 GFAP 가 살아나지만 사후 선택이 된다

고등학생처음부터 다시

1강부터 18강까지를 한 번에 이어 붙인다.

단계	강
자료 정리	4~9강
메타분석	10강
이질성 확인	13강
두 층 겹치기	17강
순위표	이 강

각 단계를 따로 배웠으니 이제 하나의 흐름으로 잇는다

위 위젯의 값은 전부 실제 계산 결과입니다. 손잡이를 돌리면 문턱과 정렬이 그 위에 다시 적용돼요.

1️⃣

I² 상한을 25% 로

GFAP·SOD1·PTPRC 가 사라집니다. 유명한 것들이 다 빠져요

2️⃣

k = 5 만

1,761개로 줄고, 남는 건 오래 알려진 유전자들입니다

3️⃣

면역 유전자를 빼기

상위 목록이 통째로 비어 버립니다 — 11강에서 본 그대로

4️⃣

여덟 개를 표시

KCNB2 말고는 한참 아래에 있습니다

고등학생조직 전체 세 시리즈만 따로

13강에서 본 이질성의 원인이 세포 분리 여부 였다.

시리즈	방식
세 개	조직 전체
나머지	레이저 절단 등

조직 전체만 합치면

GFAP 이 살아난다.

이질성이 줄고 신호가 선명해진다.

그런데 표본이 준다

다섯에서 셋으로. 검정력이 떨어진다.

이질적인 것을 나누면 표본을 잃고 신호를 얻는다 — 이 강의에서 반복되는 절충

재현 가능성은 코드가 아니라 결정의 기록에서 나옵니다.

Python 브라우저에서 실행

# 이 분석을 재현하려면 적어 둬야 하는 것들.
recipe = [
    ("시리즈",        "GSE18920 · GSE26927 · GSE20589 · GSE833 · GSE139384"),
    ("내려받은 날",   "2026-08-30"),
    ("표본 선택",     "ALS 와 대조만. NSIP 격인 AD·PD·HD·MS·조현병·PDC 는 제외"),
    ("구획 선택",     "GSE18920 은 운동신경세포만 (전각은 14강에서 따로)"),
    ("메타데이터",    "특성 줄을 통째로 이어 붙여 열쇠로 찾는다 (줄 번호 안 씀)"),
    ("사후지연",      "보정에 쓰지 않음. 못 읽은 값의 개수만 기록"),
    ("눈금",          "선형이면 log2. 표본별 중앙값 정렬"),
    ("탐침 접기",     "유전자당 분산 최대인 탐침 하나"),
    ("합칠 조건",     "세 시리즈 이상에 있는 유전자만 (k >= 3)"),
    ("효과크기",      "Hedges' g (J 보정)"),
    ("합치기",        "무작위효과 · DerSimonian-Laird tau^2"),
    ("다중검정",      "Benjamini-Hochberg"),
    ("하위군",        "나누지 않음 (조직별로 나누면 각 무리가 너무 작다)"),
]
for k, v in recipe:
    print(f"{k:14s} : {v}")
print()
print(f"열세 줄입니다. 이 중 여섯 줄은 /geo 강의에는 없던 것들이에요 —")
print("자료가 지저분할수록 적어야 할 결정이 늘어납니다.")

고등학생순위표를 어떻게 만드나

기준	내용
효과 크기	얼마나 변했나
유의성	FDR
이질성	I² 가 낮은가
두 층 일치	17강
표적 가능성	약을 만들 수 있나

여러 기준을 어떻게 합치나

방법	내용
순차 필터	하나씩 걸러냄
가중 점수	합쳐서 하나로
순위의 순위	각 기준의 순위를 합침

여러 기준을 합치는 규칙도 하나의 선택이고, 그 선택이 순위를 바꾼다

고등학생이 순위표를 어떻게 쓰나

쓰임	내용
실험 우선순위	무엇부터 볼까
가설 생성	—
기존 지식과 대조	18강

확정된 표적 목록이 아니다

"이것이 ALS 의 표적이다" 가 아니라 "이것부터 실험해 보자" 다.

그리고 순위 자체를 과신하면 안 된다

점수가 비슷하면 순위는 우연 이다.

상위 몇 개를 묶어서 후보군으로 본다.

순위표의 값어치는 정확한 순서가 아니라 상위권을 좁혀 준다는 데 있다

🤔 확인 문제

I² 상한을 25% 로 걸면 목록에서 사라지는 것들은?

🤔 확인 문제

13강에서 GFAP 를 살리려고 '조직을 통째로 잰 셋만' 따로 보는 것이 위험한 이유는?