Lesson 13 of 20

GFAP 의 I² 는 92.5% — 다섯이 서로 다른 말을 한다

이 강의의 실제 I² 값 · 알려진 ALS 유전자들

3강에서 SOD1·TARDBP·FUS 가 평평하다고 했습니다. 그때 I² 가 82%, 84%, 58% 라고 지나갔죠. 이제 그 숫자를 봅니다.

ALS 에서 잘 알려진 유전자들의 실제 결과입니다.

유전자	무엇인가	합친 g	q	I²	k
`GFAP`	별아교세포 표지 — ALS 에서 확실히 는다	+1.10	0.655	92.5%	5
`TYROBP`	미세아교세포 신호	+0.65	0.918	93.6%	4
`S100B`	별아교세포 단백질	+1.02	0.706	91.8%	4
`CD44`	활성 별아교세포	+0.76	0.820	91.5%	5
`AQP4`	별아교세포 물통로	+0.98	0.457	86.2%	5
`SOD1`	원인 유전자	−0.14	0.984	82.2%	5

High schoolGFAP 의 I² 는 92.5%

I² 는 메타분석에서 이질성 을 재는 지표다.

I²	뜻
0%	연구들이 같은 말
50%	중간
92.5%	서로 아주 다른 말

GFAP 은 성상교세포 표지다

ALS 에서 올라갈 것 으로 기대되는 유전자인데 시리즈마다 결과가 다르다.

다섯이 서로 다른 말을 한다 — 그러면 합친 값이 무엇을 뜻하나

High school왜 다른가

이유	내용
조직이 다름	척수 vs 전두엽
세포 분리 여부	레이저 절단은 교세포가 없음
플랫폼	탐침이 다름
병기	환자마다 진행 정도

두 번째가 결정적일 수 있다

레이저로 운동신경세포만 잘라내면 성상교세포가 없다.

그러면 GFAP 이 안 올라간다.

19강에서 확인한다

조직 전체를 잰 세 시리즈만 따로 보면 GFAP 이 살아난다.

이질성의 원인을 알면 자료를 나눠 볼 수 있고 신호가 되살아난다

왜 이렇게 어긋날까요? 우리는 이미 이유를 다 봤습니다.

🧠

조직이 다르다

척수와 전두엽에서 별아교세포의 반응이 같을 리 없습니다 (9강)

🔬

세포냐 조직이냐

레이저로 뽑은 운동신경세포에는 별아교세포가 없습니다

📏

칩이 다르다

1999년 칩과 2019년 칩의 탐침이 같은 자리를 볼 리 없습니다

⏱️

사후지연이 다르다

기관마다 다르고, 대개 기록도 없습니다 (7강)

두 번째가 특히 크게 작용합니다. GFAP 는 별아교세포의 유전자인데, 운동신경세포만 레이저로 뽑은 시리즈에서는 별아교세포가 거의 없어요. 그러니 GFAP 신호가 안 나옵니다.

High school알려진 ALS 유전자들도 평평하다

유전자	발현 차이
SOD1	거의 없음
TARDBP	거의 없음
FUS	거의 없음

3강에서 예고한 것이 확인된다

원인 유전자인데 발현은 안 변한다.

이것이 뜻하는 것

발현 분석은 원인 유전자를 못 찾는다. 하류 변화 만 본다.

그래도 유용할 수 있다

하류에서 개입 지점 을 찾을 수 있다.

원인을 못 찾는 방법도 결과의 사슬에서 개입점을 줄 수 있다

무엇을 쟀는지가 다르면 답이 다릅니다. I² 가 그걸 알려 줍니다.

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# 왜 GFAP 가 시리즈마다 다르게 나오는가 — 재는 대상이 다르기 때문.
series = [
    ("GSE18920",  "운동신경세포만 (레이저)", 0.03, "별아교세포가 거의 없다"),
    ("GSE20589",  "운동신경세포만 (레이저)", 0.03, "별아교세포가 거의 없다"),
    ("GSE833",    "척수 회백질 (통째로)",    0.45, "별아교세포가 많다"),
    ("GSE26927",  "경수 (통째로)",           0.45, "별아교세포가 많다"),
    ("GSE139384", "대뇌 (통째로)",           0.40, "별아교세포가 많다"),
]
print(f"{'시리즈':11s} {'무엇을 쟀나':24s} {'별아교세포 비율':>14s}")
for gse, what, frac, why in series:
    print(f"{gse:11s} {what:24s} {frac:14.2f}   {why}")
print()
print("별아교세포의 유전자(GFAP)를 잰다면,")
print("별아교세포가 3% 인 표본과 45% 인 표본에서 같은 답이 나올 수 없습니다.")
print("I2 = 92.5% 는 계산의 실패가 아니라 자료가 정직하게 말하는 것입니다.")

High schoolI² 가 높으면 어떻게 하나

대응	내용
합치지 않음	서로 다른 것을 잼
하위군으로 나눔	조직별 · 방법별
이질성의 원인을 조사	메타회귀
그대로 보고	이질성을 명시하며

두 번째가 이 강의의 선택이다

19강에서 조직 전체 세 시리즈만 따로 본다.

그러면 표본이 줄어든다

다섯에서 셋으로 줄면 검정력이 떨어진다.

대신 이질성이 줄어 신호가 선명해진다.

이질적인 것을 나누면 표본을 잃고 신호를 얻는다 — 어느 쪽이 나은지는 경우마다 다르다

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GFAP 가 ALS 에서 오르는 것이 확실한데 q = 0.655 로 나온 이유는?

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