14강 / 20강
마이코플라스마 — 안 보이는데 결과를 뒤집는다
논문 Fig. S7C 「confirmed to be Mycoplasma-free ... e-Myco plus (iNtRON, 25237)」
배양세포의 오염원 가운데 가장 고약한 것이 마이코플라스마입니다. 이유가 셋 있어요.
그런데 세포의 성질은 바꿔 놓습니다. 아미노산과 뉴클레오타이드를 가로채 먹으니까요.
| 바뀌는 것 | 어떻게 |
|---|---|
| 자라는 속도 | 느려진다 — 약이 듣는 것처럼 보인다 |
| 유전자 발현 | 수백 개가 흔들린다 — RNA-seq 이 엉뚱한 답을 낸다 |
| 약에 대한 반응 | 달라진다 — 재현이 안 된다 |
이것이 재현성 위기의 큰 원인 가운데 하나로 꼽힙니다. 전 세계 배양세포의 15~35%가 오염돼 있다는 조사가 여럿 있어요.
논문은 어떻게 확인했나
All cell lines used in this study were periodically confirmed to be
Mycoplasma-free (Fig. S7C) using the e-Myco™ plus Mycoplasma PCR Detection Kit
(iNtRON, 25237).
PCR 로 확인합니다. 마이코플라스마의 rRNA 유전자를 겨냥한 프라이머로 배양 상등액을 돌려, 밴드가 뜨는지 봅니다.
periodically — 정기적으로 라는 말이 중요합니다. 한 번 확인하고 끝이 아니라, 새 세포를 받을 때마다·주기적으로 확인합니다. 언제든 새로 들어올 수 있으니까요.
그리고 Fig. S7C 에는 네 세포주가 모두 나옵니다 — LLC1 · KLN205 · HEK293T · A549. 하나라도 오염돼 있으면 그 세포가 들어간 모든 그림이 흔들립니다.
🤔 확인 문제
마이코플라스마에 항생제(페니실린 계열)가 듣지 않는 이유는?
해설 페니실린 계열은 세포벽 합성을 막습니다. 마이코플라스마는 애초에 세포벽이 없어요. 그래서 표적 자체가 없습니다.