세포를 껐다 켜서
암을 되돌린다
유전자 하나를 스위치 하나로 보면, 세포 하나는 0과 1의 짧은 줄이 됩니다. 그 줄을 규칙대로 굴리면 세포의 운명이 나오고요.
이 20강에서는 유전자 여덟 개짜리 암세포 디지털 트윈을 직접 세우고, 가능한 모든 유전자 조작을 전부 시험해 암 어트랙터를 없애는 표적을 찾아냅니다. KAIST 조광현 교수팀이 DDX54 를 찾아낸 방식(MObyDiCK)의 뼈대를 가장 작은 크기로 손수 만들어 보는 강의입니다. 파이썬은 이 페이지 안에서 바로 실행됩니다. 설치할 것은 없습니다.
이렇게 배웁니다
🧱바닥부터 쌓는다
스위치 하나에서 시작합니다. 상태 벡터 · 논리 규칙 · 동기 갱신 · 어트랙터 · 베이슨을 한 층씩 올려 7강에서 완성된 트윈을 세웁니다.
▶️전부 계산해 본다
256가지 세포를 하나도 빠뜨리지 않고 끝까지 굴립니다. 실험실에서는 불가능한 일이 브라우저에서 1초면 끝납니다.
⚠️속는 법을 먼저
계기판을 부수고 '암 0' 을 만드는 법, 브레이크를 끄고 암을 늘리는 법, 분모를 바꿔 효과를 부풀리는 법 — 함정을 직접 밟아 봅니다.
🛠️만지며 익히기
강마다 실험실 위젯이 하나씩 — 스위치 누르기, 궤적 재생, 골짜기 굴리기, 화살표 뒤집기를 직접 돌려 봅니다.
전체 커리큘럼
01
유전자를 스위치로 본다 — 세포 하나가 숫자 몇 개가 되기까지
상태 벡터와 2ⁿ
✓
02
규칙이 세포를 만든다 — AND · OR · NOT 세 글자
논리식으로 조절 관계를 적는다
✓
03
시간을 흘려보낸다 — '동시에' 갱신한다는 것
궤적, 그리고 순서가 만드는 함정
✓
04
어트랙터 — 세포의 운명은 몇 가지인가
고정점과 순환, 그리고 '이미 본 상태'
✓
05
베이슨 — 16가지 세포를 전부 굴려 운명 지도를 그린다
전수 조사가 주는 것
✓
06
이름 붙이기 — 어떤 어트랙터가 '암' 인가
표현형은 계산이 아니라 해석이다
✓
07
디지털 트윈을 세운다 — 유전자 여덟 개짜리 암세포
DDX54 · p53 · MDM2 · CD47 · PDL1 그리고 면역세포
✓
08
되먹임 고리 — p53 과 MDM2 는 왜 진동하는가
음성 되먹임이 만드는 시계
✓
09
두 개의 골짜기 — 왜 암세포는 스스로 돌아오지 않나
쌍안정과 되돌아갈 수 없는 문턱
✓
10
동시에 vs 하나씩 — 갱신 방식이 답을 바꾼다
동기 · 비동기, 그리고 모형의 인공물
✓
11
섭동 — 유전자를 붙박아 두는 한 줄
녹아웃(KO)과 과발현(OE)
✓
12
첫 가상 녹아웃 — DDX54 를 꺼 본다
지형이 통째로 바뀌는 순간
✓
13
전수 스크리닝 — MObyDiCK 이 하는 일
모든 유전자를 하나씩 끄고 켜 본다
✓
14
가역화 효율 — 우리는 무엇을 세고 있나
분모를 정하는 문제
✓
15
죽이기와 되돌리기 — 그리고 세 번째 상태
병용요법이 만든 '휴면'
✓
16
함정 셋 — 계기판 부수기 · 브레이크 끄기 · 0 의 유혹
모형이 거짓말하는 세 가지 방식
✓
17
조합 폭발 — 이중 섭동과 2ⁿ 의 벽
왜 전수 조사는 금방 불가능해지는가
✓
18
규칙이 틀렸다면 — 화살표 하나를 흔들어 본다
강건성 검사와 그 한계
✓
19
예측에서 실험으로 — 트윈이 말할 수 있는 것과 없는 것
시뮬레이션과 습식 실험 사이의 간극
✓
20
마무리 — 우리가 만든 것과 진짜 MObyDiCK
스무 강이 남긴 것
✓