조합은 곱하기다 — 체계적으로 다 돌려 보기

상의 세 벌과 바지 두 벌이 있으면 옷차림은 다섯 가지가 아니라 여섯 가지입니다. 상의 하나마다 바지 둘을 걸칠 수 있으니까요.

UTR 도 같습니다. 논문의 문장입니다.

논문이 이름을 적은 것은 5′ 셋과 3′ 둘입니다.

여섯 개를 다 돌려 봅니다. 이것이 논문이 말하는 “체계적으로” 입니다.

다 돌린 뒤에는 무엇으로 고르나

여섯 개를 다 접어 봤다고 합시다. 손에 여섯 개의 MFE 값이 남습니다. 무엇으로 고를까요.

네 자가 서로 다른 답을 낼 수 있습니다. 19강에서 여섯 조합을 실제로 표로 만들고 자를 바꿔 가며 순위가 어떻게 흔들리는지 봅니다.

왜 더하기가 아니라 곱하기인가

고르기가 서로 독립이면 곱해집니다. 5′ 을 무엇으로 정하든 3′ 의 선택지는 그대로 둘입니다.

이 “독립” 이 이 권에서 참인 까닭이 있습니다. UTR 은 번역되지 않으므로 5′ 을 바꿔도 3′ 이 해야 할 일이 달라지지 않습니다. III 권의 에피토프 조립과 다릅니다 — 거기서는 앞 조각이 뒤 조각의 절단에 영향을 줬습니다.

다만 완전히 독립은 아닙니다. 10강에서 본 대로 두 끝이 만나 고리를 만듭니다. 그래서 곱셈으로 목록을 만들고, 실제 성능은 조합마다 따로 봅니다.

여섯 개를 돌린 뒤 남는 것

표 한 장입니다. 줄 여섯, 열은 자의 개수만큼. 그 표가 19강에서 우리가 직접 만들 것입니다.

이 표를 만들 줄 알면 이 권의 실무는 끝납니다. 남은 14~18강은 그 표를 잘못 읽는 방법들을 다룹니다.