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가장 좋았던 짝 — 5′ TMSB10 과 3′ Apo A-II

선택 단계 · 바이러스 코딩 서열과 함께 쓸 때

가장 좋았던 짝 — 5′ TMSB10 과 3′ Apo A-II
양끝은 따로 고르는 것이 아닙니다. 짝으로 보고됐고, 짝으로 씁니다.

논문에 이 권의 결론에 가장 가까운 한 줄이 있습니다.

가장 좋았던 짝 — 5′ TMSB10 + 3′ Apo A-II
(바이러스 코딩 서열과 함께 쓸 때)

다섯 후보 가운데 이 둘이 함께 쓰였을 때가 가장 좋았습니다. 괄호 안의 조건을 놓치면 안 됩니다 — 바이러스 CDS 와 함께 썼을 때입니다.

5′ 셋과 3′ 둘을 조합해 보세요. 논문이 보고한 짝 하나가 표시됩니다.
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“가장 좋았다” 는 어디까지 말하나

말할 수 있다
보고된 비교에서 이 짝이 가장 좋았다. 사람 발현용 첫 후보로 이 짝을 고르는 것이 합리적이다
말할 수 없다
이 짝이 우리 MEVC 에서도 가장 좋다. 다른 다섯 조합보다 몇 배 낫다. 사람에게서 효과가 있다

오른쪽 상자의 가운데 줄을 보세요. 몇 배 라는 말을 못 씁니다. 논문에 수치가 없기 때문입니다. 순위만 있고 크기가 없습니다.

가진 정보가 순위뿐이면 할 수 있는 결정도 먼저 시험할 것을 고르는 데까지입니다.
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이 강에서 정하는 것

결정은 “첫 번째로 돌려 볼 조합” 입니다. 다르게 정하면 무엇이 뒤집히나 — 아무것도 뒤집히지 않습니다. 순서만 바뀝니다. 어차피 11강에서 전부 돌려 볼 것이기 때문입니다.

이것이 이 권의 성격입니다. 앞의 다섯 권에서는 한 번 고르면 되돌리기 어려웠습니다. UTR 은 갈아 끼울 수 있습니다. 코딩 서열을 건드리지 않으니까요.

“바이러스 코딩 서열과 함께” 라는 단서

논문은 이 짝을 적으면서 조건을 붙였습니다 — 바이러스 CDS 와 함께 쓸 때.

왜 조건이 붙을까요. UTR 은 CDS 와 한 분자가 되기 때문입니다. 5′ UTR 의 끝은 CDS 의 시작과 코자크 맥락을 나눠 가지고(3강), 전체 GC 와 전체 접힘은 세 조각이 함께 만듭니다(18강).

UTR 의 성능은 혼자 정해지지 않는다

그래서 “TMSB10 이 좋은 UTR 이다” 보다 “바이러스 CDS 와 함께 쓴 이 조합이 좋았다” 가 더 정확한 문장입니다. 우리 MEVC 도 바이러스 유래이지만 같은 분자는 아닙니다.

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논문이 가장 좋았다고 적은 UTR 짝은?
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“이 짝이 가장 좋았다” 로부터 말할 수 없는 것은?
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UTR 선택이 앞의 다섯 권의 결정들과 다른 점은?