18. 내 실험실에 놓을 상자를 그린다 · Dr. Yoo's On-Demand mRNA Synthesiser, First Steps III

이제 부품이 손에 다 있습니다. 조립해 봅니다. 순서가 중요합니다.

순서	묻는 것	예
1	무엇을 만드나	후보 스크리닝용 시료? 동물실험용? 임상용 원료?
2	얼마나 · 얼마나 자주	주당 100 µg × 20종? 월 10 mg × 1종?
3	어느 품질까지	발현만 보면 되나? dsRNA 를 재야 하나? GMP 인가?
4	제약은	예산 · 공간 · 사람 · 규제
5	그제서야 모듈 선택	1~4 가 답을 거의 정해 준다

흔한 실수는 5번부터 시작하는 것입니다. “마이크로유체가 좋다더라” 로 시작하면 필요 없는 복잡함을 사게 됩니다.

요구사항을 넣으면 모듈 선택이 거의 자동으로 따라옵니다.

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# 요구사항을 넣으면 모듈 선택이 어떻게 갈리는지
def recommend(purpose, monthly_ug, quality, budget):
    r = []
    # IVT
    if monthly_ug > 5000 or purpose == "screen":
        r.append(("IVT", "진동/흐름 IVT", "많은 양 또는 잦은 반복 — 시간이 값이다"))
    else:
        r.append(("IVT", "배치 IVT", "가끔·소량이면 배치가 단순하고 싸다"))
    # 소화
    if quality in ("preclinical", "gmp"):
        r.append(("소화", "고정 DNase 막", "효소 캐리오버를 애초에 없앤다"))
    else:
        r.append(("소화", "배치 DNase", "연구용이면 충분하다"))
    # 정제
    if quality == "research":
        r.append(("정제", "oligo-dT 비드", "값싸고 단순. 끊긴 것은 못 거른다"))
    else:
        r.append(("정제", "다중모드 모놀리스", "회수율과 선택성이 필요하다"))
    # 제어
    r.append(("제어", "센서 게이팅" if quality != "research" else "시간 기반",
              "재현성이 필요하면 상태로 넘어가야 한다"))
    # 포장
    r.append(("포장", "별도 SHM 칩" if purpose != "screen" else "필요 없음",
              "두 논문 모두 통합하지 못한 자리"))
    if budget == "low" and quality != "research":
        r.append(("경고", "예산과 품질 목표가 어긋난다", "품질을 낮추거나 예산을 올려야 한다"))
    return r

cases = [
    ("후보 스크리닝 20종/주", dict(purpose="screen", monthly_ug=2000, quality="research", budget="low")),
    ("전임상 동물실험용",     dict(purpose="animal", monthly_ug=8000, quality="preclinical", budget="mid")),
    ("임상 1상 원료",        dict(purpose="clinical", monthly_ug=50000, quality="gmp", budget="high")),
]
for name, kw in cases:
    print("■ " + name)
    for blk, choice, why in recommend(**kw):
        print("   %-6s %-16s %s" % (blk, choice, why))
    print()

요구사항 네 개를 골라 보세요. 추천 모듈 구성과 그 근거가 함께 나옵니다.

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세 가지 구성안

A안 — 가벼운 스크리닝대

배치 IVT · 배치 DNase · oligo-dT 비드 · 시간 기반 제어.
싸고 단순. 후보 서열을 빠르게 훑는 데 충분. 품질은 “발현되나” 까지.

B안 — [A] 형 통합 상자

PCR 부터 정제까지 한 상자 · 자성 비드 · 워크플로 파일.
주형 준비까지 포함. 서열이 자주 바뀌는 자리에 맞다. 8시간에 300 µg.

C안 — [B] 형 흐름 라인

진동 IVT · 고정 DNase 막 · MMC · HF-TFF · 센서 게이팅 · 전체 로깅.
2시간에 1.2 mg, 품질 검사 가능. 대신 장비와 사람이 더 든다.

세 안 모두 포장은 따로 입니다. 그리고 세 안 모두 서열 확인은 밖에서 해야 합니다.

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공정 설계를 시작할 때 가장 먼저 정해야 할 것은?

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“후보 20종을 매주 스크리닝” 하는 실험실에 과한 구성은?