20강 / 20강

정리 — n 이 하나라는 것

제10장 「n이 하나라는 것」 · 제14장 「그런데 백신 때문인가」 · 제15장

표적 셋이 나왔습니다. mRNA 가 설계됐습니다. 6주 뒤 종양의 지름이 6.5 cm 에서 3.4 cm 로 줄었습니다.

그리고 라첼 알라베나가 폴에게 말했습니다.

"오늘 제가 말할 수 있는 건 종양이 줄었다는 것까지예요.
백신 때문에 줄었다는 건 아직 말할 수 없어요."

왜 말할 수 없는가 — 네 가지 다른 설명

#	다른 설명	배제할 수 있나
1	비만세포종은 저절로 줄기도 한다. 드물지만 보고돼 있다	못 한다
2	앞서 받은 수술과 항암제의 늦은 효과	못 한다
3	재는 사람이 결과를 알고 있었다 — 눈가림이 안 됐다	못 한다
4	우연. 6주 사이에 무슨 일이든 일어날 수 있다	못 한다

그리고 라첼이 기울게 만드는 것 셋을 함께 적어 둡니다.

#	백신 쪽으로 기울게 하는 것	로지에게서
1	시점 — 반응이 투여 뒤에, 면역치료의 시간표와 어긋나지 않게 나왔는가	✔ 맞았다
2	T세포 — 그 펩타이드를 보여 줬을 때 반응하는 세포가 늘었는가	✔ 늘었다. 다만 "접시 하나에 점 몇 개 차이"
3	에피토프 스프레딩 — 넣지 않은 항원까지 공격받기 시작했는가	✘ 확인할 방법이 없었다

라첼의 결론 — "둘은 맞고 하나는 못 봤어요. 그래서 저는 이렇게 씁니다 — 백신 투여 후 부분 반응이 관찰되었다. 인과를 주장하지 않는 문장이에요."

그래도 가능했다는 아무것도 아닌 것이 아닙니다. 소설의 문장입니다.

Python 브라우저에서 실행

# n=1 에서 무엇을 말할 수 있나 — 확률로
# 자연 관해가 드물게 일어난다고 하자. 그 확률을 p 라고 하면
for p in (0.01, 0.05, 0.10, 0.20):
    print(f"자연 관해 확률 {p:>5.0%}  →  한 마리에서 관해를 봤을 때")
    print(f"                          '우연이 아니다' 는 유의수준 {p:.2f} 에서만 말할 수 있다")
print()
print("한 마리에서 얻는 최대 증거가 이것뿐입니다.")
print("그리고 이 계산조차 <자연 관해 확률을 안다> 는 가정 위에 있습니다.")
print("개 비만세포종의 자연 관해 확률은 잘 알려져 있지 않습니다.")
print()
print("비교할 대상이 없다는 것 — 같은 로지에게 백신을 주지 않은 경우를 볼 방법이 없다는 것.")
print("그것이 n=1 의 뜻입니다.")

그리고 앞으로 일어날 수 있는 일

14장에서 라첼이 미리 적어 둔 것입니다.

면역 회피

면역계가 아홉 글자를 표적으로 삼으면, 그 아홉 글자를 내걸지 않는 세포가 살아남습니다. 변이를 잃은 세포일 수도, MHC I 을 표면에서 내려 버린 세포일 수도 있습니다.
내걸지 않으면 보이지 않고, 보이지 않으면 죽지 않습니다.

T세포 소진

같은 표적을 오래 마주하면 T세포는 지칩니다. 반응이 무뎌지고 힘이 떨어집니다.
그래서 몇 주 간격으로 다시 놓아 클론을 다시 불려 줍니다

13강에서 왜 셋을 넣었는가가 여기서 다시 뜻을 갖습니다 — "하나를 잃어도 둘이 남는다."

라첼의 마지막 말 — "기뻐하되 달력은 계속 보고 있읍시다."

여섯 달 동안 배운 것 대부분은 주장하는 방법이었습니다. 마지막에 배우는 것은 주장하지 않는 방법입니다.

Python 브라우저에서 실행

# 이 두 권이 지나온 길 — 한 줄로
path = [
    ("I권 8~10강",  "FASTQ 네 파일",        "200 GB",     "읽어 온 조각"),
    ("I권 11~17강", "BAM 두 개",            "60× / 30×",  "제자리에 놓고 믿을 만하게"),
    ("II권 2~5강",  "VCF",                  "—",          "달라진 자리"),
    ("II권 6~7강",  "체세포 변이 후보",     "4,847",      "종양에는 있고 혈액에는 없는 것"),
    ("II권 8~11강", "숫자를 읽는다",        "VAF 0.847",  "리드의 비율이지 세포의 비율이 아니다"),
    ("II권 12~13강","드라이버",             "KIT D816V",  "얻은 것과 버린 것"),
    ("II권 14~17강","신생항원",             "3",          "IC50 87 · 143 · 298 nM"),
    ("II권 18강",   "개의 코돈",            "0.61→0.89",  "개 세포가 잘 읽는 문장으로"),
    ("—",           "그다음",               "0.5 mL",     "/mrna 15~19강"),
]
w = max(len(p[1]) for p in path) + 2
for where, what, num, memo in path:
    print(f"  {where:<12}{what:<{w}}{num:>12}   {memo}")
print()
print("200 GB → 4,847 → 3 → 0.5 mL.")
print()
print("그리고 마지막 줄에 이것을 더합니다 —")
print("  '백신 투여 후 부분 반응이 관찰되었다. 인과를 주장하지 않는 문장이에요.'")

수의학이라 가능했던 것

10장에 규정 이야기가 나옵니다. 이것도 이 워크숍이 가르쳐야 할 것입니다.

"사람에게라면 이 일은 시작조차 못 한다. 임상시험 승인이 필요하고, 그 앞에 동물시험과 독성시험과 제조 기준이 있다. 몇 년과 수백만 달러가 든다."

"수의학은 다르다. 표준 치료가 실패한 반려동물에게, 보호자가 충분히 알고 동의하고, 대학의 동물윤리위원회가 심의해 승인하면, 아직 허가되지 않은 치료를 시도할 수 있는 길이 있다."

로지는 이미 수술과 항암을 했고 실패했습니다. 그 조건을 충족했습니다. 그리고 라첼이 서류를 썼습니다.

이 이야기가 '노트북 한 대로 누구나 할 수 있다' 로 읽히면 안 됩니다. 15장의 제목이 「위험한 절반」 인 것이 그래서입니다.