This lesson is only available in Korean for now.
Opening the molecule
behind the name
/bio and /gene use DDX54 as a name. They call CD38 simply immunosuppressive.
These 20 lessons open up what is behind those names — DEAD is four amino acids, the p- is a phosphate carrying charge −2, and CD38 is the enzyme that cleaves NAD⁺.
How you'll learn
🔍Start from one line of the paper
Every lesson unfolds one line from the paper or its appendix. Each subtitle says exactly which line.
🎛️Move the dials yourself
Raise the pH, add salt, pull off a phosphate. You see what collapses, right there.
⚖️Paper values and textbook constants, kept apart
20 mM HEPES is from the paper; pKa 7.55 is a textbook constant. The two are always labelled separately on screen.
🗺️Draw the molecular map at the end
In lesson 19 you fill molecules into every arrow of Fig. 6H. The previous eighteen lessons all meet there.
Full curriculum
01
논문 속의 분자들 — 이름 뒤를 연다
DEAD-box · NAD⁺ · 인산기 · IgG 가 무엇인지부터
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02
원자와 결합 — 세기가 다른 세 가지
공유결합 · 이온결합 · 수소결합
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03
물 — 모든 반응이 일어나는 자리
극성 · 수소결합 · 소수성 효과
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04
pH 와 pKa — 로그 눈금 하나 더
파이썬 14강의 log2 와 같은 이야기
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05
완충액 — 왜 20 mM HEPES pH 7.2 인가
SI 「Western blot analysis」의 용해 완충액
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06
생체분자 넷 — 당·지질·단백질·핵산
무엇이 물에 녹고 무엇이 막을 만드나
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07
뉴클레오타이드 — 아데닌 하나가 네 곳에 있다
염기 · 당 · 인산 세 조각
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08
DNA 와 RNA — 산소 하나가 갈랐다
2′-OH 와 DV200 > 30%
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09
염기쌍과 녹는점 — GC 가 더 붙잡는다
수소결합 2개 대 3개, 그리고 Tm
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10
아미노산 스무 가지 — 곁사슬이 성격이다
그리고 DEAD 는 Asp-Glu-Ala-Asp 다
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11
단백질이 접히는 힘 — 물이 민다
1·2·3·4차 구조, 그리고 SDS 가 무너뜨리는 것
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12
효소 — 반응의 언덕을 낮춘다
활성부위 · 기질특이성 · Km 과 kcat
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13
ATP — 에너지가 아니라 인산기 운반체
DEAD-box 헬리케이스가 실제로 하는 일
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14
인산화 — 곁사슬에 −2 전하를 붙인다
SI Table S4 의 p-JAK1 · p-STAT3 · p-p65 항체
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15
NAD⁺ 와 CD38 — 이 논문의 핵심 반응
본문 Discussion 「Cd38 breaks down extracellular NAD⁺」
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16
아데노신 — 또 하나의 억제 경로
본문 Fig. 7 「genes linked to adenosine production」
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17
항체 — 분자가 분자를 알아보는 법
SI 「200 µg anti-mouse PD1 · 100 µg isotype control」
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18
돌연변이는 화학이다 — 시토신 탈아미노화
TMB 가 왜 그렇게 생겼는지
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19
【실습】 논문의 분자 지도를 그린다
본문 Fig. 6H 를 분자 수준으로 다시
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20
정리 — 화학이 답하는 것과 못 하는 것
그리고 여기서 어디로
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